[发明专利]一种蛋白互作阻断多肽的辅助筛选方法有效

专利信息
申请号: 202010950586.3 申请日: 2020-09-11
公开(公告)号: CN112034184B 公开(公告)日: 2021-12-14
发明(设计)人: 纪晓峰;盛军;郑媛;郝建华 申请(专利权)人: 中国水产科学研究院黄海水产研究所
主分类号: G16B15/30 分类号: G16B15/30;G01N33/68
代理公司: 青岛海昊知识产权事务所有限公司 37201 代理人: 曾庆国
地址: 266071 山*** 国省代码: 山东;37
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摘要: 发明提供一种蛋白互作阻断多肽的辅助筛选方法,是以中国对虾蛋白PcRab7和白斑综合症病毒囊膜蛋白VP28相互作用阻断多肽为目标的筛选方法。本发明方法是构建中国对虾Rab7蛋白和白斑综合征病毒WSSV囊膜蛋白VP28的复合体结构PcRab7‑VP28;确定复合体结构PcRab7‑VP28的相互作用界面;然后以WSSV囊膜蛋白VP28为受体靶标蛋白,根据其活性区域设定活性口袋;将待筛选的多肽片段,在设定的活性口袋位置与受体靶蛋白VP28依次对接,并计算多肽与VP28的结合自由能;根据自由能高低筛选出阻断多肽。本发明所建立的蛋白互作阻断多肽的筛选方法基于相互作用的阻断多肽筛选,能弥补传统的仅仅依赖实验筛选的高成本短板,能做到多范围、多长度的多肽筛选。
搜索关键词: 一种 蛋白 阻断 多肽 辅助 筛选 方法
【主权项】:
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