[发明专利]一种内分泌干扰物与核受体作用的别构位点识别方法有效
| 申请号： | 202011216404.6 | 申请日： | 2020-11-04 |
| 公开（公告）号： | CN112420122B | 公开（公告）日： | 2021-06-22 |
| 发明（设计）人： | 史薇;张驰;陈钦畅;郭婧;于红霞;谭皓月 | 申请（专利权）人： | 南京大学 |
| 主分类号： | G16B5/00 | 分类号： | G16B5/00;G06F30/20;G16B15/00;G16B40/00;G06F111/04;G06F119/14 |
| 代理公司： | 江苏瑞途律师事务所 32346 | 代理人： | 陈彬 |
| 地址： | 210093 江*** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种内分泌干扰物与核受体作用的别构位点识别方法，属于计算毒理学领域。该方法首先获取并优化受体蛋白的晶体结构，构建并优化正构配体分子、非竞争性配体分子结构，然后，构建核受体‑正构配体分子复合体，并将非竞争性配体分子放置于远离核受体表面的位置，构建核受体‑正构配体分子‑非竞争性配体分子三元复合体，并对三元复合体进行分子动力学模拟；然后，进行全局搜索分子动力学模拟；将获取的分子运动轨迹进行位置聚类分析，根据非竞争性配体分子在模拟空间范围内的团簇分布进行团簇优先级排序，识别潜在的别构位点。本发明不受已知信息、初始蛋白构象和化合物种类的限制，能够对核受体表面潜在的别构位点进行高效准确识别。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 内分泌 干扰 受体 作用 别构位点 识别 方法 | ||
【主权项】：
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