[发明专利]一种检测基因编辑效率和基因编辑模式的方法及其应用在审

专利信息
申请号: 202011218400.1 申请日: 2020-11-04
公开(公告)号: CN112322714A 公开(公告)日: 2021-02-05
发明(设计)人: 韩铖潇;徐珂;周浩;何川;丁金梅;秦超;罗怀希;孟和 申请(专利权)人: 上海交通大学
主分类号: C12Q1/6869 分类号: C12Q1/6869;G16B30/10
代理公司: 上海科盛知识产权代理有限公司 31225 代理人: 褚明伟
地址: 200240 *** 国省代码: 上海;31
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摘要: 发明涉及一种检测基因编辑效率和基因编辑模式的方法及其应用,属于基因检测技术领域。该方法包括以下步骤:S1,提取样本基因组DNA,对待测区设计引物并扩增;S2,构建文库进行高通量测序,并对数据进行过滤、拆分和拼接,得到待测区序列;S3,将待测区序列与基因组参考序列比对,得到每个样本的基因编辑效率和模式;S4,对处理组样本和对照组样本的基因编辑效率作显著性分析并输出校正后结果。与现有技术相比,本发明简化了基因文库构建过程,加快了数据分析处理的速度,提高了基因编辑效率检测的经济性、敏感性、特异性和准确性,也提供了对基因编辑模式的多维度评估。
搜索关键词: 一种 检测 基因 编辑 效率 模式 方法 及其 应用
【主权项】:
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