[发明专利]一种基于瘤内具核梭杆菌预测食管鳞癌转移的方法在审
申请号: | 202011324362.8 | 申请日: | 2020-11-13 |
公开(公告)号: | CN112391474A | 公开(公告)日: | 2021-02-23 |
发明(设计)人: | 石超;李臻;马杰;唐颢;郭永军 | 申请(专利权)人: | 河南省肿瘤医院 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/689;C12Q1/06;C12R1/01 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 450000 河*** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | 本发明公开了一种基于瘤内具核梭杆菌预测食管鳞癌转移的方法,具体涉及生物医学领域,包括有效检测人食管鳞癌组织内具核梭杆菌,所述具核梭杆菌特异性基因nusG的引物序列特征为:根据具核梭杆菌的nusG基因mRNA序列Gene ID:45633894,基因组序列为NZ_LN831027.1。本发明通过qPCR检测肿瘤组织内的具核梭杆菌的DNA表达含量,利用预设的cutoff值判定阳性或阴性;其次通过全外显子测序技术检测肿瘤组织的肿瘤突变负荷,利用预设的cutoff值判定高TMB或者低TMB;当F.nucleatum结果为阳性并且高TMB,食管癌更易发生转移;结合两个检测结果建立的预测模型可能成为预测食管鳞癌转移的有力方法。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 瘤内具核梭 杆菌 预测 食管 转移 方法 | ||
【主权项】:
暂无信息
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