[发明专利]Kraken2软件输出结果的优化方法及鉴定样本中物种类型的方法在审
| 申请号： | 202011583243.4 | 申请日： | 2020-12-28 |
| 公开（公告）号： | CN112614544A | 公开（公告）日： | 2021-04-06 |
| 发明（设计）人： | 王涛;肖姗姗;常壹昭 | 申请（专利权）人： | 杭州瑞普基因科技有限公司 |
| 主分类号： | G16B30/10 | 分类号： | G16B30/10;G16B50/00 |
| 代理公司： | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 | 代理人： | 刘雅婷 |
| 地址： | 311100 浙江省杭州市五常*** | 国省代码： | 浙江;33 |
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| 摘要： | 本发明提出了Kraken2软件输出结果的优化方法，所述方法包括：将测序结果中每个读段的子读段与已知数据库中的物种序列进行匹配，获取每个读段中匹配上每个物种的子读段的kmer数，选择每个读段中各kmer数中的最大值，记作kmermax数；将所述kmermax数与第一阈值进行比较，当所述kmermax数小于等于第一阈值时，去除所述kmermax数对应的读段，以便对所有读段进行过滤。本发明的方法可以准确地优化Kraken2软件输出结果，避免出现假阳性现象，可以应用于鉴定样本中物种类型。 | ||
| 搜索关键词： | kraken2 软件 输出 结果 优化 方法 鉴定 样本 物种 类型 | ||
【主权项】：
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