[发明专利]一种无参考基因组的群体变异检测分析方法在审
申请号: | 202011596548.9 | 申请日: | 2020-12-29 |
公开(公告)号: | CN112735516A | 公开(公告)日: | 2021-04-30 |
发明(设计)人: | 徐昊;姜丽荣;孙子奎 | 申请(专利权)人: | 上海派森诺生物科技股份有限公司 |
主分类号: | G16B20/20 | 分类号: | G16B20/20;G16B40/00 |
代理公司: | 上海点威知识产权代理有限公司 31326 | 代理人: | 胡志强 |
地址: | 200030 上海市*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | 本发明公开了一种无参考基因组的群体变异检测分析方法,1)通过dd‑RAD的方法进行样本测序,测序后得到每个样本的数据使用flash软件包将有overlap的read1与read2连接起来,通过聚类软件对每个样本的序列聚类,提取每个样本序列中的consensus序列;2)将步骤1)得到的每个样本序列的consensus序列合并,然后进行聚类,过滤,得到群体的consensus序列,通过本发明使无参考基因组的群体进化分析更加高效,可以极大提高变异检测的速度和准确度。 | ||
搜索关键词: | 一种 参考 基因组 群体 变异 检测 分析 方法 | ||
【主权项】:
暂无信息
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