[发明专利]一种靶向RalA-GDP蛋白的药物的虚拟筛选方法在审

专利信息
申请号: 202110045500.7 申请日: 2021-01-14
公开(公告)号: CN114765064A 公开(公告)日: 2022-07-19
发明(设计)人: 卜华港;张雅亮;夏玉贵 申请(专利权)人: 南京天顶星医药科技有限公司
主分类号: G16C20/50 分类号: G16C20/50;G16C20/64;G16C20/90;G16B15/30
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 210000 江苏*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明为一种靶向RalA‑GDP蛋白的药物的虚拟筛选方法。本发明提供了一种靶向RalA‑GDP蛋白的药物的虚拟筛选方法,包括以下步骤:(1)RalA‑GDP蛋白结构的准备:从Protein Data Bank数据库中获取RalA‑GDP的晶体结构,去除多余结构,只保留RalA‑GDP部分,并进行结构优化;(2)设定活性口袋:在RalA‑GDP蛋白的Switch2和α2螺旋以及α3螺旋的一面附近找到一个可供容纳小分子的结合口袋,以该结合口袋作为活性位点;(3)建立待筛选的化合物库:从ZINC化合物库中下载需要的小分子库,并对化合物库中的小分子进行优化处理;(4)化合物筛选:使用Discovery Studio软件中的Dock Ligands(LibDock)模块对受体和小分子配体进行对接,对最后的对接结果进行分析,筛选出候选化合物。本发明提供的虚拟筛选方法具有快速、高效、低成本等优点,可缩短药物研发周期,降低盲目性与研发成本。
搜索关键词: 一种 靶向 rala gdp 蛋白 药物 虚拟 筛选 方法
【主权项】:
暂无信息
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