[发明专利]一种获得染色体水平基因组的方法有效
| 申请号： | 202110202878.3 | 申请日： | 2021-02-23 |
| 公开（公告）号： | CN112908415B | 公开（公告）日： | 2022-05-17 |
| 发明（设计）人： | 曲俊杰;尹玲 | 申请（专利权）人： | 广西壮族自治区农业科学院 |
| 主分类号： | G16B20/30 | 分类号： | G16B20/30;G16B20/20 |
| 代理公司： | 南宁市吉昌知识产权代理事务所(普通合伙) 45125 | 代理人： | 李秋琦 |
| 地址： | 530007 广西壮族*** | 国省代码： | 广西;45 |
| 权利要求书： | 查看更多 | 说明书： | 查看更多 |
| 摘要： | 本发明公开了一种获得染色体水平基因组的方法。通过对比基于Hi‑C数据组装的基因组scaffold和基于大片段mate‑pair文库组装的基因组scaffold的contig顺序，保留基因组scaffold中与基于Hi‑C数据组装结果的顺序一致的contig，将不一致的contig打断，重复以上步骤，直至不再出现新的一致的contig顺序，得到经过校正的染色体水平基因组。本发明使用Hi‑C技术辅助对组装到基因组scaffold的结果进行校正，在不重新进行基因组测序的情况下，最大化的利用已测序的数据，保证组装结果正确的情况下，既最大化的保留了第二代测序基于大片段文库组装结果中正确的scaffold连接，又不影响Hi‑C染色体水平的准确性。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 获得 染色体 水平 基因组 方法 | ||
【主权项】：
暂无信息
下载完整专利技术内容需要扣除积分，VIP会员可以免费下载。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息，商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于广西壮族自治区农业科学院，未经广西壮族自治区农业科学院许可，擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作，请联系【客服】
本文链接：http://www.vipzhuanli.com/patent/202110202878.3/，转载请声明来源钻瓜专利网。
