[发明专利]三维基因组Hi-C数据中TAD嵌套结构检测方法及系统在审
| 申请号： | 202110390522.7 | 申请日： | 2021-04-12 |
| 公开（公告）号： | CN113178230A | 公开（公告）日： | 2021-07-27 |
| 发明（设计）人： | 吴昊;艾兆恒;董记华 | 申请（专利权）人： | 山东大学 |
| 主分类号： | G16B30/10 | 分类号： | G16B30/10;G16B30/20;G16B40/00;G06N3/04;G06N3/08 |
| 代理公司： | 济南圣达知识产权代理有限公司 37221 | 代理人： | 李圣梅 |
| 地址： | 250101 山东*** | 国省代码： | 山东;37 |
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| 摘要： | 本公开提出了三维基因组Hi‑C数据中TAD嵌套结构检测方法及系统，包括：针对获取的低分辨率Hi‑C数据，进行双端测序并各自对比，根据对比结果进行合并并筛选有效配对后，用有效的配对构建接触矩阵；运用深度学习网络模型对低分辨率Hi‑C数据进行增强；利用原始低分辨率Hi‑C数据和增强后不同来源的Hi‑C数据，检测TAD嵌套结构。结合了数据增强和结构检测两部分功能，通过输入不同精度的Hi‑C实验数据，能够得到同样全面细致的TAD及其嵌套结构整体分析，在突破实验条件限制的同时降低了测序成本，提升了本方法可应用的范围。 | ||
| 搜索关键词： | 三维 基因组 hi 数据 tad 嵌套 结构 检测 方法 系统 | ||
【主权项】：
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