[发明专利]一种融合了单细胞TCR测序数据的肿瘤新生抗原筛选方法有效
申请号: | 202110443345.4 | 申请日: | 2021-04-23 |
公开(公告)号: | CN113160887B | 公开(公告)日: | 2022-06-14 |
发明(设计)人: | 蒋庆华;许召春;王平平;周文洋 | 申请(专利权)人: | 哈尔滨工业大学 |
主分类号: | G16B20/50 | 分类号: | G16B20/50;G16B50/00;C12Q1/6869;C12Q1/6886;G16B5/00;G16B30/10;G16B30/20 |
代理公司: | 西安铭泽知识产权代理事务所(普通合伙) 61223 | 代理人: | 姬莉 |
地址: | 150000 黑龙江省*** | 国省代码: | 黑龙江;23 |
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摘要: | 本发明公开了一种融合了单细胞TCR测序数据的肿瘤新生抗原筛选方法,包括:基于全外显子测序数据及转录组测序数据通过软件进行质控、比对等步骤获取新生突变肽库;使用HLA分型预测软件预测HLA‑I类分型;结合单细胞TCR测序及单细胞转录组测序,通过细胞类型注释、克隆频率分析寻找癌症特异性的CD8+T细胞受体;同时,基于集成深度学习通过peptide‑TCR相互作用预测模型鉴定短肽免疫原性,提出融合单细胞TCR测序数据的肿瘤新生抗原筛选方法,解决了传统肿瘤抗原筛选方法新生抗原错选漏选率高、免疫原性不足等问题。 | ||
搜索关键词: | 一种 融合 单细胞 tcr 序数 肿瘤 新生 抗原 筛选 方法 | ||
【主权项】:
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