[发明专利]判断背景引入微生物序列的方法及其应用有效
申请号: | 202110466665.1 | 申请日: | 2021-04-28 |
公开(公告)号: | CN113270145B | 公开(公告)日: | 2022-05-06 |
发明(设计)人: | 许腾;何福生;李晓蕾;谢淑媚;王小锐;李永军;苏杭 | 申请(专利权)人: | 广州微远基因科技有限公司;广州微远医疗器械有限公司;广州微远医学检验实验室有限公司;深圳微远医疗科技有限公司;微远(深圳)医学研究中心有限公司 |
主分类号: | G16B30/10 | 分类号: | G16B30/10;G16B40/20;G16B40/30;G16B50/00 |
代理公司: | 广州新诺专利商标事务所有限公司 44100 | 代理人: | 李海恬 |
地址: | 510130 广东省广州市高新技术产业开发*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本发明涉及一种判断背景引入微生物序列的方法及其应用,属于生物信息分析技术领域。该方法包括以下步骤:确定背景微生物列表:取若干病原微生物阴性样本,将各微生物丰度的定量值A与核酸总量D进行相关性检验,呈负相关则判定为背景病原微生物;判断模型建立:分别取背景病原微生物的阴性对照样本集和阳性样本集,将背景病原微生物基因序列数据比对至该微生物的特征序列区域,计算丰度,建立判断模型;微生物特异性区域定量分析:获取待测样本中背景病原微生物基因序列数据,采用上述判断模型进行判断。该方法能够准确判断测序所得微生物序列是否为背景引入,且可降低批次假阳或者假阴问题,可广泛应用于病原微生物检测的数据分析中。 | ||
搜索关键词: | 判断 背景 引入 微生物 序列 方法 及其 应用 | ||
【主权项】:
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