[发明专利]用于马鹿血源含量检测的SNP位点、筛选方法、对应SNP芯片及应用有效
申请号: | 202110601666.2 | 申请日: | 2021-05-31 |
公开(公告)号: | CN113122644B | 公开(公告)日: | 2023-08-25 |
发明(设计)人: | 邢秀梅;王天骄;范欢欢;张然然;王洪亮;刘汇涛;李洋;董依萌 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院特产研究所 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11;G16B20/20 |
代理公司: | 北京超凡宏宇专利代理事务所(特殊普通合伙) 11463 | 代理人: | 李双艳 |
地址: | 130112 吉林省长*** | 国省代码: | 吉林;22 |
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摘要: | 本发明涉及分子生物学技术领域,提供了一种用于马鹿血源含量检测的SNP位点、筛选方法、对应SNP芯片及应用。本发明在构建鹿系统发育树的基础上,采用群体间遗传分化指数Fst对重测序结果中的SNP位点进行筛选,并通过排除中侧翼序列、探针设计侧的干扰序列和G‑C转变和A‑T转变位点,进一步提高得到的SNP位点质量,最终得到大量能够用于杂交鹿血源含量评价的SNP位点,这些SNP位点组合作为芯片应用于杂交鹿血源含量检测时,能够精准区分F1~F3代杂交鹿,对梅花鹿保种、育种和鹿茸生产中具有重大应用价值。 | ||
搜索关键词: | 用于 马鹿 含量 检测 snp 筛选 方法 对应 芯片 应用 | ||
【主权项】:
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