[发明专利]一种基于LD精减GBS标记划分玉米群体结构的方法在审
| 申请号： | 202110734163.2 | 申请日： | 2021-06-30 |
| 公开（公告）号： | CN113450878A | 公开（公告）日： | 2021-09-28 |
| 发明（设计）人： | 崔震海;刘涛;贺伟;阮燕晔;张敖;董小妹;曹慧颖 | 申请（专利权）人： | 沈阳农业大学 |
| 主分类号： | G16B40/00 | 分类号： | G16B40/00;C12Q1/6895 |
| 代理公司： | 济南市新图新夏天专利代理事务所(普通合伙) 37330 | 代理人： | 陈体芝 |
| 地址： | 110000 辽*** | 国省代码： | 辽宁;21 |
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| 摘要： | 本发明涉及分子育种技术领域，且公开了一种基于LD精减GBS标记划分玉米群体结构的方法，包括以下步骤：S1：设置LD精减梯度筛选记：根据连锁不平衡利用plink软件对GBS数据进行筛选（利用系统命令符操作plink），最后可以得到四个梯度精减的分子标记集；S2：数据格式转换：通过S1步骤利用plink筛选结束后会生成prune.in文件和prune.out文件；S3：初步判断群体结构：以筛选后基因型文件为输入文件，然后对群体结构分析，最后根据Delta K作为判定群体最佳亚群个数（K值）依据。该一种基于LD精减GBS标记划分玉米群体结构的方法，可大量减少GBS的分子标记数量，以降低运算量，并增加其准确性，解决了部分软件如BIO‑R、STRUCTURE无法载入GBS原始数据的问题。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 ld 精减 gbs 标记 划分 玉米 群体 结构 方法 | ||
【主权项】：
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