[发明专利]一种植物中sgRNA活性预测方法及装置在审
申请号: | 202111138368.0 | 申请日: | 2021-09-27 |
公开(公告)号: | CN113838529A | 公开(公告)日: | 2021-12-24 |
发明(设计)人: | 邹权;牛梦婷;丁漪杰;杜军平 | 申请(专利权)人: | 电子科技大学长三角研究院(衢州) |
主分类号: | G16B30/00 | 分类号: | G16B30/00;G06Q10/04;G06N3/04;G06K9/62 |
代理公司: | 成都创新引擎知识产权代理有限公司 51249 | 代理人: | 林庆华 |
地址: | 324003 浙江省衢*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | 本发明提供一种植物中sgRNA活性预测方法及装置,方法包括:下载sgRNA活性序列数据集,sgRNA活性序列数据集包括植物sgRNA活性数据;采用热编码方法对植物sgRNA活性数据进行编码,得到植物sgRNA序列数据;采用k‑mer编码方法对植物sgRNA序列数据进行二次编码;通过编码后的sgRNA活性序列数据集构建卷积神经网络模型;通过卷积神经网络模型按设定次数n分别对编码后的sgRNA活性序列数据集进行预测训练,得到n个训练模型,将n个训练模型集成,得到卷积神经网络预测模型sgRNACNN;将待预测的植物sgRNA活性序列输入卷积神经网络预测模型sgRNACNN中,得到预测结果。本发明的卷积神经网络预测模型sgRNACNN泛化性能较好,可应用于多物种植物sgRNA活性预测,能够实现对sgRNA活性的准确识别,具有较好的实用性能。 | ||
搜索关键词: | 一种 植物 sgrna 活性 预测 方法 装置 | ||
【主权项】:
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