[发明专利]结直肠腺瘤生物标志物、试剂盒及生物标志物的筛选方法有效
申请号: | 202210011544.2 | 申请日: | 2022-01-06 |
公开(公告)号: | CN114369673B | 公开(公告)日: | 2023-07-14 |
发明(设计)人: | 朱瑞新;高文星 | 申请(专利权)人: | 同济大学 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;G16B15/30 |
代理公司: | 上海诺衣知识产权代理事务所(普通合伙) 31298 | 代理人: | 李凯利 |
地址: | 200092 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | 本发明公开结直肠腺瘤生物标志物、试剂盒及生物标志物的筛选方法,生物标志物包括内脏奥德氏杆菌Odoribacter splanchnicus_62174、解纤维素拟杆菌Bacteroides cellulosilyticus_58046等;筛选方法包括:S1、获取疾病和正常对照组微生物测序数据及临床信息数据,并进行预处理;S2、数据进行筛选,对具有足够测序深度和覆盖度的菌株进行SNV水平的注释,获得每个菌株的SNV突变频率等信息;S3、对疾病患者和健康对照组的微生物SNV数据进行差异分析,获得不同菌株中差异显著的SNV位点;S4、筛选,确定SNV最优生物标志物;本发明提供的生物标志物及筛选方法更好地进行癌症早诊早治,具有重要的意义和临床应用价值。 | ||
搜索关键词: | 直肠 腺瘤 生物 标志 试剂盒 筛选 方法 | ||
【主权项】:
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