[发明专利]单细胞转录组R数据中gene symbol的校正方法及系统在审

专利信息
申请号: 202211575459.5 申请日: 2022-12-08
公开(公告)号: CN115938476A 公开(公告)日: 2023-04-07
发明(设计)人: 舒明月;白洁;石明明 申请(专利权)人: 深圳华大基因科技服务有限公司
主分类号: G16B20/00 分类号: G16B20/00;G16B40/00
代理公司: 武汉蓝宝石专利代理事务所(特殊普通合伙) 42242 代理人: 韩梦晴
地址: 518000 广东省深圳市盐田区*** 国省代码: 广东;44
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摘要: 发明公开了一种单细胞转录组R数据中gene symbol的校正方法及系统,其方法包括以下步骤:获取参考基因组原始基因表,根据预设gene symbol替换条件,将所述参考基因组原始基因表中的gene symbol进行转换,生成目标对照表;获取Seurat分析包中的单细胞转录组R对象数据,根据所述R对象数据的数据存储类型调用对应的函数;在每一种函数中,根据目标对照表中的gene symbol校正R对象数据中的gene symbol;通过调用不同类型的函数来针对性的对R对象数据进行校正,可有效提高单细胞转录组R对象数据中gene symbol的准确性,提高流程的连贯性以及避免代码冗余。
搜索关键词: 单细胞 转录 数据 gene symbol 校正 方法 系统
【主权项】:
暂无信息
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