[发明专利]一种基于强化学习和分子模拟的靶向多肽设计方法及系统在审
申请号: | 202211692002.2 | 申请日: | 2022-12-28 |
公开(公告)号: | CN115985384A | 公开(公告)日: | 2023-04-18 |
发明(设计)人: | 李高登;李津辰;安铎;周晓城 | 申请(专利权)人: | 星希尔生物科技(上海)有限公司 |
主分类号: | G16B5/00 | 分类号: | G16B5/00;G16B15/30;G16B40/00;G06N3/0455;G06N3/0442;G06N3/092 |
代理公司: | 北京中南长风知识产权代理事务所(普通合伙) 11674 | 代理人: | 穆丽红 |
地址: | 200131 上海市浦东新区中国*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | 本发明公开了一种基于强化学习和分子模拟的靶向多肽设计方法,包括:分别训练多肽分子生成器和多肽‑靶点蛋白相互作用预测器,并对多肽分子生成器和多肽‑靶点蛋白相互作用预测器联用进行强化学习获得多肽氨基酸分布的新潜空间;从新潜空间采样生成新颖多肽分子集合,并与靶点蛋白进行分子对接获取多肽‑靶点蛋白复合物三维结构;基于多肽‑靶点蛋白复合物三维结构进行分子动力学模拟,计算结合自由能,按照结合自由能从大大小排序并推荐分子。还公开对应系统及应用。克服了传统设计方法的化学空间小、容易引入免疫原性问题、难以评估和靶点蛋白亲和力及专利空间不足缺点,降低工作人员对领域知识依赖,提高新型药物设计开发效率,缩短研发周期。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 强化 学习 分子 模拟 靶向 多肽 设计 方法 系统 | ||
【主权项】:
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