[发明专利]用于微生物学实验室日常诊断中迅速检测和鉴别临床样品中普通细菌病原体和抗生素抗性基因之特异性和通用性探针及扩增引物

摘要

本发明涉及基于DNA的通用的细菌检测方法，用于直接从临床样品或者从细菌菌落特异性地检测肺炎克雷伯氏菌、铜绿假单胞菌、奇异变形菌、肺炎链球菌、金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌、粪肠球菌、腐生葡萄球菌、酿脓链球菌、流感嗜血菌和粘膜炎莫拉氏菌以及特异性地检测通常遇到的和与临床有关的细菌抗生素抗性基因。上述细菌物种总共可以占到常规微生物学实验室分离到的细菌病原体的80％。本发明的核心内容主要包括得自所有物种特异性基因组DNA片段的DNA序列以及源于这些序列的任何寡核苷酸序列，所述的片段是经杂交从基因组文库选择的或从数据库选择的，所述的寡核苷酸序列可以用作PCR或任何其它核苷酸扩增方法的探针或扩增引物。本发明也包括选择的临床相关抗生素抗性基因的DNA序列。

主权项

1.一种在怀疑包含有细菌核酸的任何样品中使用探针(片段和/或寡核苷酸)和/或扩增引物的方法，所述探针和/或扩增引物对检测核酸的存在和/或其量而言是特异的、普遍的和敏感的，所述核酸得自选自下组的细菌物种：大肠杆菌、肺炎克雷伯氏菌、铜绿假单胞菌、奇异变形菌、肺炎链球菌、金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌、粪肠球菌、腐生葡萄球菌、酿脓链球菌、流感嗜血菌和粘膜炎莫拉氏菌，其中所说的细菌核酸或其变体或部分包含可与所说的探针或引物杂交的选择的靶区，该方法包括以下步骤：使所说的样品与所述的探针或引物接触，并检测指示所说的任何细菌物种的存在和/或其量的杂交探针或扩增产物的存在和/或其量。