[发明专利]用于病原体及相关抗生素抗性基因检测以进行诊断的种、属特异性和通用的探针及引物

摘要

公开了基于DNA的、利用扩增引物或探针检测、鉴定和定量测定测试样品中下述来源的DNA的方法(i)任何细菌,(ii)无乳链球菌、腐生葡萄球菌、屎肠球菌、脑膜炎奈瑟氏球菌、单核细胞增生利斯特氏菌和白假丝酵母,为(iii)链球菌、葡萄球菌、肠球菌、奈瑟氏球菌和假丝酵母各属的任何种类。也公开了基于DNA的、利用扩增引物或探针检测、鉴定和定量测定测试样品中选自下述的抗生素抗性基因的方法blatem、blashv、blarob、blaoxa、blaZ、aadB、aacC1、aacC2、aacC3、aac6’－IIa、aacA4、aad(6’)、vanA、vanB、vanC、msrA、satA、aac(6’)－aph(2”)、vat、vga、ermA、ermB、ermC、mecA、int和sul。上述微生物种、属和抗性基因均是多种临床标本中临床相关的和常见的,这些基于DNA的检测法比较快速、准确,可以用于临床微生物为实验室中进行常规诊断。这些新型方法应可用于提高微生物感染诊断的速度和准确度,因此可以达到更有效的治疗。也要求了用于(i)细菌的通用检测和定量测定,和/或(ii)上述细菌和真菌种和/或属的检测,鉴定和定量测定,和/或(iii)上述抗生素抗性基因的检测,鉴定和定量测定的诊断试剂盒。

主权项

1.使用特异性、普遍适用并灵敏的探针和/或扩增引物从怀疑含有下述细菌和/或真菌核酸的任何样品中确定下列来源的核酸的存在和/或量的方法：-选自下列组中的抗生素抗性基因：blatem、blashv、blarob、blaoxa、blaZ、aadB、aacC1、aacC2、aacC3、aac6′-IIa、aacA4、aad(6′)、vanA、vanB、vanC、msrA、satA、aac(6′)-aph(2″)、vat、vga、ermA、ermB、ermC、mecA、int和sul，以及-选自下列组中的特定细菌和真菌菌种：屎肠球菌、单核细胞增生利斯特氏菌、脑膜炎奈瑟氏球菌、无乳链球菌、白假丝酵母、肠球菌属、奈瑟氏球菌属、葡萄球菌属、链球菌属和假丝酵母属，其中所述每一种核酸或其变体或其部分包含可与所述探针或引物杂交的选定靶区域；所述方法包括下列步骤：在杂交或扩增的相同条件下使所述样品与所述探针或引物接触，并检测已杂交的探针或扩增产物的存在和/或量，以作为所述特定细菌和/或真菌菌种或属，同时还有所述细菌抗生素抗性基因的存在和/或量的指征。