[发明专利]双链DNA和杂环低聚物之间复合物的形成

摘要

本发明提供了在双链DNA和杂环、脂肪族氨基酸、特别是Ω氨基酸和极性末端基团的低聚物之间形成复合物的方法和组合物。通过适当选择靶序列和低聚物的组合物,得到具有低解离常数的复合物。该复合物的形成可被用于鉴定特定的双链DNA序列,被用于抑制基因转录,并且作为治疗剂用于抑制不期望的细胞的增殖或不期望的基因的表达。

主权项

1.一种在靶双链DNA和1到2个低聚物在小沟中的位点形成特异的复合物的方法，其中对所述的低聚物进行选择以提供Ka为至少109M-1的与所述的靶双链DNA的结合，所述的低聚物含有作为核心结构的：(1)5到6个环成员的有机环基团，其中至少60％的环是具有1到3个杂原子的杂环，其中杂原子是氮，氧和硫，并且其中至少60％的杂环至少具有一个氮原子，其中所述的低聚物被限定为具有至少6个所述的含有氮的杂环，其中所述的杂环中的至少一个是特异于A，G，C或T的，并且杂环的互补对参照核苷酸的互补对，所述的低聚物含有至少两个与作为第一低聚物的自身或与作为第二低聚物的另一个低聚物形成互补对的两个连续的杂环的单元，其中当所述的低聚物与它自身形成所述的互补对时，所述的低聚物含有形成发夹回转的内部分子，并且当两个低聚物形成所述的互补对时，所述的两个低聚物含有一种2到6个碳原子的内部脂肪族氨基酸，其中所述的内部脂肪族氨基酸优先与A和T并列，并且与它自身形成互补对，和有机环基团末尾上的至少一个末端：(2)2到6个碳原子的脂肪族氨基酸；和(3)含有一个极性基团的烷基链，该极性基团从连接所说的烷基链和低聚物的其余部分的键具有2至4个碳原子，所述的杂环通过2个碳原子的链连接，该链含有NH基团，以便与所述双链DNA的可以得到的氮和氧原子形成氢键，先决条件是远离所述的小沟的表面的氢原子可以利用总数不超过100个碳原子的取代基取代，所述的方法包括：在复合物形成条件下将所述的低聚物与双链DNA放置在一起，从而在所述的第一个和第二个低聚物之间在靶双链DNA处形成复合物。