[发明专利]测定多核苷酸序列变异的方法

摘要

测定第一种多核苷酸与第二种多核苷酸之间核苷酸序列内的变异的存在与具体类型的方法,包括首先,提供第一种多核苷酸的样品,并选择第一种多核苷酸中可能含有变异的区域;然后,对选定区域进行模板产生扩增反应,以产生包含该选定区域的双链多核苷酸模板群;接着,通过片段产生反应,使用一对引物,同时由模板的两条链产生经标记的线性多核苷酸片段家族;然后,使用片段中存在的标记,测定第一种多核苷酸选定区域内至少若干碱基的定位和具体类型;再将经测定的碱基的定位和具体类型,与第二种多核苷酸的碱基的定位和具体类型进行比较,从而鉴定第一种多核苷酸选定区域与第二种多核苷酸相应区域之间的核苷酸序列变异的存在和具体类型。

主权项

1．测定第一种多核苷酸和第二种多核苷酸之间核苷酸序列变异的存在和具体类型的方法，包括：a)提供第一种多核苷酸的样品；b)选择第一种多核苷酸可能含有变异的区域；c)对选定区域进行模板产生扩增反应，以产生包含所选定区域的双链多核苷酸模板群；d)通过片段产生反应，使用一组引物，同时由模板的两条链产生经标记的线性多核苷酸片段家族其中片段家族的每个片段由终止物于片段的3’末端终止，且其中片段家族包括在以引物为侧翼的模板链部分的每个可能碱基处终止的至少一个片段，用终止物表示；e)使用片段中存在的标记，测定第一种多核苷酸选定区域中至少一些碱基的定位和具体类型；并f)将测定的碱基的定位和具体类型与第二种多核苷酸的碱基的定位和具体类型进行比较，由此鉴定第一种多核苷酸选定区域和第二种多核苷酸相应区域之间核苷酸序列变异的存在和具体类型。