[发明专利]一种定量检测趋化因子表达水平的方法无效
申请号: | 01132232.2 | 申请日: | 2001-11-19 |
公开(公告)号: | CN1362527A | 公开(公告)日: | 2002-08-07 |
发明(设计)人: | 熊思东;叶巍;陈习武;储以微 | 申请(专利权)人: | 复旦大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 上海正旦专利代理有限公司 | 代理人: | 吴桂琴 |
地址: | 200032*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 定量 检测 因子 表达 水平 方法 | ||
技术领域
本发明属生物技术领域,涉及一种定量检测趋化因子LARC表达水平的方法,和构成本发明方法的关键内对照质粒。
背景技术
随着PCR(Polymerase Chain Reaction)技术在基础研究、临床诊断等各个领域的广泛应用,人们逐渐意识到仅仅停留在PCR的定性应用上的诸多局限性。生命科学研究,已超出了最初“有/无”的简单的定性范围,而需要更精准的“多/少”的定量概念。以HIV、HBV、HCV等病毒研究为例,定量PCR检测病毒基因,可协助判断潜伏的感染者及无症状携带者的情况,并可从测定结果来判断药物的治疗效果、推测复发的可能性;至于mRNA的RT-PCR定量更能进一步反映病毒的转录水平、活动性、复制性等指标。
LARC(Liver and Activation-Regulated Chemokine)是1997年日本学者Hieshima发现并鉴定的一个新的CC类趋化蛋白。LARC在生理状态下在人肝脏中有一定水平的表达,是肝脏中的一看家趋化蛋白;LARC可趋化活化T淋巴细胞、记忆T淋巴细胞、B淋巴细胞等免疫活性细胞表面,在乙肝病毒感染的病毒特异性细胞免疫,尤其是CTL杀伤肝细胞、清除病毒的免疫应答过程中有重要的角色。LARC的表达水平与其相关疾病如乙型肝炎的免疫状态、转归、预后等的判断具有重要意义。由于LARC与大多数趋化蛋白一样,具有瞬时分泌、含量微弱、局部表达、而不进入循环等的特点,无法用传统的定量方法对其进行精确的定量,所以,需要建立一个良好的分子水平的定量系统,对LARC转录及翻译进行较为准确的定量,用较为精准的量化概念反映该分子的表达水平。
目前常用的对趋化因子进行定量的方法有酶联免疫吸附试验(ELISA)、免疫组织化学实验和定量RT-PCR/PCR法等。其中ELISA方法较为迅速简便,但需要体液如血清、分泌物等为检测对象,且精确度和敏感性较差,而趋化蛋白恰恰又是一种分泌水平相对微弱的蛋白质,这势必限制了该方法的应用。免疫组化实验能直观地对趋化蛋白的表达进行定位、定量研究,但对抗体的要求较高、且仅局限于对一些胞内分泌型趋化蛋白的检测,而大多数趋化蛋白往往具有广泛弥散性分泌的特点。定量PCR技术是根据PCR的产物量来推断其原始模板量的方法。常用的定量方法主要有外标法(external standard)、内标法(internal standard)和实时荧光法(real time)三种。外标法具有操作简便、快速等特点,但由于PCR反应是一指数变化过程,反应过程中任一参数如模板起始量、引物浓度、DNA聚合酶活性、反应温度、循环时间、循环数等的微小变化都会显著改变终产物的量,反应前几个循环的不均一性、各反应管不同的升降温效率等将造成无法避免的管间差异,使定量结果的可靠性大为降低。内标法是在定量系统中设立内参照,将参照基因与待测基因在同一反应管内共同进行扩增,这样可在很大程度上消除“管间差异”带来的误差。
发明内容
本发明的目的是建立能对LARC转录及翻译水平进行相对精确的定量cQRT-PCR系统,用较为准确的量化概念反映LARC的表达水平。
本发明通过构建含有与LARC特异性引物互补序列的特定内参照质粒,以同一对引物在同一反应管中竞争扩增LARC,从而对LARC的表达水平进行定量,建立了定量检测趋化因子LARC表达水平的cQRT-PCR技术。并通过对已知量的LARC水平、HBV不同感染状态下体外培养细胞及病人活检肝组织标本中LARC表达量的研究和测定,验证了本方法具备了较高的可靠性和准确性。
本发明的技术方案是通过以下步骤实现的:
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