[发明专利]基因多态性检测方法、诊断方法以及用于其的装置及检验试剂盒无效
申请号: | 200580039423.3 | 申请日: | 2005-11-18 |
公开(公告)号: | CN101061223A | 公开(公告)日: | 2007-10-24 |
发明(设计)人: | 中村祐辅;田中敏博;大西洋三;花房信博;绪方是嗣;四方田聪 | 申请(专利权)人: | 株式会社岛津制作所;独立行政法人理化学研究所 |
主分类号: | C12N15/09 | 分类号: | C12N15/09;C12M1/00;C12Q1/68;G06F17/30;G06F19/00 |
代理公司: | 中科专利商标代理有限责任公司 | 代理人: | 李贵亮 |
地址: | 日本*** | 国省代码: | 日本;JP |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基因 多态性 检测 方法 诊断 以及 用于 装置 检验 试剂盒 | ||
1.一种基因多态性检测方法,其中,包括:
使未实施核酸提取操作的生物体样品,直接作用于含有将多个多态性位点分别夹在中间并结合的多个引物的基因扩增反应液,使基因组DNA扩增的扩增工序;和
使对应所述多个多态性位点配制而成的侵入试剂作用于在所述扩增工序中扩增的基因组DNA,辨别所述多个多态性位点的碱基的分型工序。
2.根据权利要求1所述的基因多态性检测方法,其中,
成为检测对象的多态性,是单碱基多态性。
3.根据权利要求1或2所述的基因多态性检测方法,其中,
所述扩增工序使用PCR法。
4.根据权利要求1或2所述的基因多态性检测方法,其中,
所述分型工序使用侵入法或Taqman PCR法。
5.一种诊断方法,其中,
准备针对特定的多态性或多个多态性的组合的诊断值,作为数据库,
基于利用权利要求1所述的方法检测出的多态性的结果,从所述数据库读取诊断值。
6.一种基因多态性检测装置,其中,具备:
设置未实施核酸提取操作的生物体样品的样品设置部;
保持含有将多个多态性位点分别夹在中间并结合的多个引物的基因扩增反应液的扩增试剂保持部;
保持对应所述多个多态性位点配制而成的分型试剂的分型试剂保持部;
为了使添加到所述基因扩增反应液中的所述生物体样品在反应液内扩增基因组DNA而控制该反应液的温度的扩增部;
具有对分别对应所述多个多态性位点而发出荧光的探针进行保持的探针固定部,为了使在所述扩增部扩增的基因组DNA和所述分型试剂的反应液与各探针发生反应而控制反应液的温度的分型反应部;
可以移动到所述样品设置部、所述扩增试剂保持部、所述分型试剂保持部、所述扩增部及所述分型反应部的位置,将样品、扩增试剂、分型试剂及样品与这些试剂的反应液分注到规定位置的分注装置;
向所述分型反应部的各探针固定部照射激发光来检测荧光的荧光检测装置;和
对所述扩增部及分型反应部的温度控制、所述分注装置的分注动作以及所述荧光检测装置的检测动作进行控制的控制部。
7.根据权利要求6所述的基因多态性检测装置,其中,
所述分型反应部在每个所述探针固定部具备上部开口并供给反应液的凹部。
8.根据权利要求7所述的基因多态性检测装置,其中,
进一步具有保持防止反应液蒸发的油的油保持部,
所述分注装置在向所述凹部分注反应液之前或之后,可以向所述凹部分注所述油。
9.根据权利要求6所述的基因多态性检测装置,其中,
所述分型反应部在每个所述探针固定部具备供给反应液的流道。
10.根据权利要求9所述的基因多态性检测装置,其中,
所述流道在每个所述探针固定部具备反应液的供给用入口和排出用出口。
11.根据权利要求9所述的基因多态性检测装置,其中,
所述流道与反应液的供给用共用入口和排出用共用出口连接。
12.根据权利要求9~11中任意一项所述的基因多态性检测装置,其中,
所述探针固定部为在所述流道内一部分变宽的部分。
13.根据权利要求6所述的基因多态性检测装置,其中,
所述分型反应部具备在内部形成有多个所述探针固定部的流道。
14.根据权利要求6~13中任意一项所述的基因多态性检测装置,其中,
所述样品设置部与所述扩增部共用温度调节部。
15.一种检验试剂盒,其中,其是如下所述的结构形成为一体的试剂盒,这些结构包括:
收容含有分别将多个多态性位点夹在中间并结合的多个引物的基因扩增反应液的扩增试剂收容部;收容有对应所述多个多态性位点配制而成的分型试剂的分型试剂收容部;以及将分别对应所述多个多态性位点并发出荧光的探针个别保持的多个探针固定部。
16.根据权利要求15所述的检验试剂盒,其中,
进一步将收容稀释样品的稀释液的稀释液收容部形成为一体
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