[发明专利]一种动物源细菌四环素类药物耐药基因多重PCR检测技术有效

专利信息
申请号: 200610022076.X 申请日: 2006-10-20
公开(公告)号: CN100412206C 公开(公告)日: 2008-08-20
发明(设计)人: 王红宁;夏青青;张安云;周万蓉;吴琦;杨鑫;田国宝 申请(专利权)人: 四川大学
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 610064*** 国省代码: 四川;51
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摘要:
搜索关键词: 一种 动物 细菌 四环素 类药物 耐药 基因 多重 pcr 检测 技术
【权利要求书】:

1. 一种动物源细菌四环素类药物耐药基因多重PCR检测方法,包括以下步骤:

[1]PCR模板的制备方法如下:

(1)LB培养基摇瓶培养增菌,包括动物粪样、组织液、血液或其它体液;

(2)取1ml经LB培养基摇瓶培养3-6h的菌液于无菌1.5mlEP管中,8000r/min离心3min, 弃上清,再加入1mlPCR模板制备试剂洗涤液,重复离心一次,弃上清,最后加入50-200ulPCR 模板制备试剂样品处理液,震荡混匀后备用;

[2]动物源细菌四环素类药物耐药基因多重PCR扩增试剂的配制方法如下:

(1)根据现有方法合成耐药基因tetA、tetC、tetM特异性引物,所述特异性引物序列如 下:

tetA:For:5’-GGCACCGAATGCGTATGAT-3’Rev:5’-AAGCGAGCGGGTTGAGAG-3’

tetC:For:5’-CTGGGCTGCTTCCTAATGC-3’  Rev:5’-AGCTGTCCCTGATGGTCGT-3’

tetM:For:5’-GAGGTCCGTCTGAACTTTGCG-3’Rev:5’-AGAAAGGATTTGGCGGCACT-3’

用1mmol/L Tris.Hcl-0.1mmol/L EDTA缓冲液稀释上述引物,使其浓度为25mmol/L;

(2)取10倍PCR缓冲液,浓度各为2.5mmol/L的dGTP、dCTP、dATP和dTTP混合物,浓 度为25mM/L的MgCl2,浓度均为25mmol/L的三种耐药基因即tetA基因、tetC基因、tetM 基因的上述特异性上下游引物,浓度为2.5U/μL的Taq DNA聚合酶和超纯水装入一无菌的 PCR反应薄壁管中;

[3].动物源细菌四环素类药物耐药基因多重PCR检测方法中试剂的组成:

(1)取10倍PCR缓冲液5μl,浓度各为2.5mmol/L的dGTP、dCTP、dATP和dTTP混合 物4μl,浓度为25mM/LMgCl25μl,浓度为2.5U/ULTaq DNA聚合酶0.35μl,浓度均为 25mmol/L的三种耐药基因即tetA基因、tetC基因、tetM基因的上述特异性上下游引物分别 1.0μl、0.3μl、0.4μl于一无菌的PCR反应薄壁管中;

(2)加入已制备好的模板5μl,补水至总体积50μl后加入20μl矿物油封顶即可;

[4].PCR扩增循环参数为:

(1)94℃预变性5min;

(2)然后进入循环:94℃变性60s、56℃退火60s、72℃延伸90s,共35个循环,最后 72℃延伸10min后,取出于4℃保存;

[5]耐药基因检测结果判定

(1)取5μl PCR产物,与1μl Loading buffer混匀后,点样于2%琼脂糖凝胶电泳板孔中, 80V电压,电泳40min,于紫外荧光成相仪下拍照判定,如果可见480bp、580bp、910bp的条带, 分别指示tetA基因、tetC基因、tetM基因的存在;

(2)直接测序鉴定法:将经过纯化的PCR产物50μl和20μl三基因的上下游引物一起进行 DNA测序。

2. 根据权利要求1所述的耐药基因多重PCR检测方法,其特征在于:所述PCR模板制备试 剂洗涤液的成份为:5%的甘油。

3. 根据权利要求1所述的耐药基因多重PCR检测方法,其特征在于:所述PCR模板制备试 剂样品处理液的成份为:60%的甘油。

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