[发明专利]诊断性传染病致病原的新颖方法无效
申请号: | 200610086755.3 | 申请日: | 2006-06-20 |
公开(公告)号: | CN101092645A | 公开(公告)日: | 2007-12-26 |
发明(设计)人: | 周锦生 | 申请(专利权)人: | 亚洲基因科技股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04 |
代理公司: | 中科专利商标代理有限责任公司 | 代理人: | 王旭 |
地址: | 台湾省*** | 国省代码: | 中国台湾;71 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 诊断 传染病 致病 新颖 方法 | ||
1.一种鉴定不同性传染病致病原的方法,其包括:
(a)以一组引物同步扩增不同致病菌的DNA片段;
(b)以不同的特异探针和扩增的DNA片段杂交;及
(c)确认杂交的产物。
2.根据权利要求1的方法,其中性传染病的致病原是选自下列群组包括细菌、病毒、真菌、立克次体或披衣菌。
3.根据权利要求1的方法,其中引物组是从不同致病原的基因组的保守区域中所设计出来。
4.根据权利要求3的方法,其中保守区域是选自下列群组包括5Sr RNA基因,16S rRNA基因,23S rRNA基因,5.0S rRNA基因,5.8S rRNA基因,18S rRNA基因,28S rRNA基因,类16S RNA基因,或类23S rRNA基因。
5.根据权利要求1的方法,其中特异的探针是由权利要求3的保守区域中的变异区域所设计出来。
6.一个设计不同性传染病致病原DNA片段引物组的步骤,其包括:
(a)在不同致病原的基因组中选出一个保守区域;
(b)将不同致病原中保守区域的序列排列;
(c)从保守区域内找出一个目标片段,其中该片段的两端序列在不同致病原中是一样的,且此片段中必须含有不同的序列,以用来鉴定不同的致病原;
(d)将目标片段的两端序列选为引物;
(e)定义正向及反向引物,其中正向引物的序列,在不同的致病原间均同为正向的引物,而反向引物的序列,在不同的致病原间均同为反向的引物;及
(f)将目标片段中不同的部分选为该致病原的特异探针。
7.根据权利要求6的步骤,其中步骤(b)的排列,是使用生物信息软件DNAsis。
8.根据权利要求6的步骤,其中性传染病的致病原是选自下列群组包括细菌、病毒、真菌、立克次体或披衣菌。
9.一组引物,用以扩增砂眼披衣菌(Chlamydiatrachomatis)及奈瑟氏淋病双球菌(Neisseria gonorrhoeae)的DNA片段,其包括:5’-CGCGAAGAACCTTACCTGGTTTTGACATG-3’及5’-GGCAACTAATGACAAGGGTTGCGCTC-3’。
10.根据权利要求9的引物组,其是由砂眼披衣菌及奈瑟氏淋病双球菌的基因组中的保守区域所设计而来。
11.根据权利要求10的引物组,其中该保守区域是由16SrRNA基因而来。
12.根据权利要求9的引物组,该引物是用生物活性物质标记。
13.根据权利要求12的引物组,其中生物活性物质是生物素。
14.一个用来鉴定从砂眼披衣菌及/或奈瑟氏淋病双球菌扩增而来的DNA片段的探针,其由下列序列组成:
(a)5’-AATGTCGTTTTCCGCAAGGACATAT-3’对砂眼披衣菌;及
(b)5’-CGGAGGAGTGCCTTCGGGAGCCGTA-3’对奈瑟氏淋病双球菌。
15.根据权利要求14的探针,该探针是从砂眼披衣菌及奈瑟氏淋病双球菌基因组的保守区域中的变异区域所设计而来,其中的不同DNA序列可用来鉴定奈瑟氏淋病双球菌及砂眼披衣菌。
16.根据权利要求15的探针,其中该保守区域是由16SrRNA基因而来。
17.根据权利要求14的探针,其以磁性颗粒标记。
18.一个检测砂眼披衣菌及奈瑟氏淋病双球菌的试剂盒,其包括:(a)用来扩增样品DNA的引物组,其包括5’-AATGTCGTTTTCCGCAAGGACATAT-3’
及5’-CGGAGGAGTGCCTTCGGGAGCCGTA-3’;及
(b)用来鉴定扩增的DNA片段的探针,包括:5’-AATGTCGTTTTCCGCAAGGACATAT-3’对砂眼披衣菌及5’-CGGAGGAGTGCCTTCGGGAGCCGTA-3’对奈瑟氏淋病双球菌。
19.根据权利要求18的试剂盒,其中该引物是用生物活性物质标记。
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