[发明专利]一种中药复方药效物质基础的虚拟筛选方法无效
申请号: | 200610130709.9 | 申请日: | 2006-12-30 |
公开(公告)号: | CN101089245A | 公开(公告)日: | 2007-12-19 |
发明(设计)人: | 刘培勋;龙伟;洪阁;高静 | 申请(专利权)人: | 中国医学科学院放射医学研究所 |
主分类号: | C40B30/02 | 分类号: | C40B30/02 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 300192*** | 国省代码: | 天津;12 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 中药 复方 药效 物质基础 虚拟 筛选 方法 | ||
1.一种中药复方药效物质基础的虚拟筛选方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)中药复方化学成分分子库的建立
对象中药复方的选择,以该复方组成药味的化学成分研究程度为衡量标准,各药味的化学成分已经基本清楚的复方作为该方法的应用对象。通过网络资源利用、文献调研建立该复方所有组成药味化学成分的分子库。
(2)功能主治的分子药理建模
根据该复方临床的功能主治,挑选其中应用广泛、疗效确切、机制清楚、作用靶点明确的几种药理作用,分别对其作用靶点分子建模。建模过程中广泛调研,或利用当前三维结构已确证的作用靶点,或通过同源模建用相关软件建立虚拟靶点。
(3)毒性筛选
运用化合物毒性预测软件对分子库中的分子进行毒性预测,淘汰毒性预测结果显示阳性的分子。
(4)类药性评估
运用ADME(药代动力学)预测软件或相关软件的ADME预测功能计算复方化学成分分子的类药性指数,指标包括多项,比如:分子量、氢键受体、氢键给体、可旋转键数、脂水分配系数、水溶性指数、分子极性表面积、分子体积、基于经验的药物类似性指数、化学焓变指数(分子稳定性指数)。依据各指数反映的分子类药性优劣,再给予各指数以优劣评分,指数最优者为1,指数最劣者为0。将每个分子的10项指数优劣性评分加和,得出总类药性评分。
(5)分子对接评测
利用分子对接软件,以复方化学成分分子为对接对象,以步骤(2)建立的药理作用P(i)(i=1,2,3…)的分子靶点(一个或多个)为对接模板进行分子对接,利用打分函数计算出每个分子与靶点对接的给分,两个或两个以上靶点的对接打分取均数。
(6)综合评分筛选
P(i)药理分子模型筛选后的分子根据式I计算总分:
总分=(Ai/Am)×100×a%+(Bi/Bm)×100×b% ……式I
注:Ai代表目标分子的类药性评分,
Am代表该药理模型下该分子库中类药性评分最高的分子打分
Bi代表目标分子的对接打分
Bm代表该药理模型下该分子库中分子对接最优的分子打分
a%代表设定的类药性评测权重(根据不同的药理模型取值在30%-70%)
b%代表设定的分子对接评测权重(根据不同的药理模型取值在30%-70%)
a%+b%=1
以总分排序,汇总得分>x的分子(x为不同药理模型下设定的阈值,一般大于50),即得到该复方P(i)药理作用分子新复方预方。
(7)药理实验验证与筛选
步骤(6)筛选出来的分子进入药理实验药效验证。建立药理作用P(i)的体外实验或体内动物实验方案,对虚拟筛选结果进行药效验证。步骤(6)筛选出来的分子中没有通过体外或体内药理实验验证者,予以淘汰。
(8)剂量配比设计
采用均匀设计的方法,以步骤(7)最后得到的数个分子为影响因素,以各分子的给药剂量为因素水平,以各配比剂量下的药理实验药效观察为考察指标,综合结果给出一个最佳配比的分子新复方。
2.根据权利要求1所述的一种中药复方药效物质基础的虚拟筛选方法,其特征在于,所述步骤(4)与步骤(5)次序调换,即先进行步骤(5),后进行步骤(4)。
3.根据权利要求1所述的一种中药复方药效物质基础的虚拟筛选方法,其特征在于,所述步骤(3)与步骤(5)次序调换,即先进行步骤(5),后进行步骤(3)。
4.根据权利要求1所述的一种中药复方药效物质基础的虚拟筛选方法,其特征在于,所述步骤(3)与步骤(4)次序调换,即先进行步骤(4),后进行步骤(5)。
5.根据权利要求1所述的一种中药复方药效物质基础的虚拟筛选方法,其特征在于,所述步骤(3)在步骤(5)之后进行。
6.根据权利要求1所述的一种中药复方药效物质基础的虚拟筛选方法,其特征在于,所述步骤(5)在步骤(3)之前进行。
7.根据权利要求1和权利要求2所述的一种中药复方药效物质基础的虚拟筛选方法,其特征在于针对肿瘤等特殊疾病的药理建模,去除所述步骤(3)。
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