[发明专利]从全基因组中富集甲基化DNA的方法及其所用层析柱组无效
申请号: | 200610147409.1 | 申请日: | 2006-12-18 |
公开(公告)号: | CN101205536A | 公开(公告)日: | 2008-06-25 |
发明(设计)人: | 秦颖;肖华胜 | 申请(专利权)人: | 上海生物芯片有限公司 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10;C12N15/12 |
代理公司: | 上海浦一知识产权代理有限公司 | 代理人: | 陈履忠 |
地址: | 201203上海*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基因组 富集 甲基化 dna 方法 及其 所用 层析 | ||
1.一种从全基因组中富集甲基化DNA的方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)制备层析柱组,该层析柱组包括甲基化DNA特异的亲和层析柱和非甲基化DNA特异的亲和层析柱;
(2)抽提待测样品DNA;
(3)将待测样品DNA与步骤(1)制备的非甲基化DNA特异的亲和层析柱进行结合反应,以去除待测样品DNA中的非甲基化DNA;
(4)把经步骤(3)所得的滤过液与甲基化DNA特异的亲和层析柱进行结合反应,以富集甲基化DNA。
2.一种适用于权利要求1所述方法的层析柱组,其特征在于,包括甲基化DNA特异的亲和层析柱和非甲基化DNA特异的亲和层析柱。
3.如权利要求2所述的层析柱组,其特征在于,所述甲基化DNA特异的亲和层析柱通过将特异性结合甲基化DNA的蛋白固定于层析柱的基质而制得。
4.如权利要求3所述的层析柱组,其特征在于,所述特异性结合甲基化DNA的蛋白包括MBD2b蛋白和kaiso蛋白。
5.如权利要求2所述的层析柱组,其特征在于,所述非甲基化DNA特异的亲和层析柱通过将特异性结合非甲基化DNA的蛋白固定于层析柱的基质而制得。
6.如权利要求5所述的层析柱组,其特征在于,所述特异性结合非甲基化DNA的蛋白包括CGBP蛋白。
7.如权利要求3或5所述的层析柱组,其特征在于,所述层析柱的基质包括溴化氰活化的Sepherose 4B、Agarose和磁珠。
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