[发明专利]一种质谱质量测量误差的预测方法

说明书

技术领域

本发明涉及质谱数据预处理方法，特别涉及一种基于离子分子式预测的质谱质量测量误差的预测方法。

背景技术

现实中任何测量工具都存在一定的测量误差。质谱仪也不例外。质谱仪的功能是测量带电离子物质的质量，在蛋白质多肽鉴定中，这些测量误差将直接影响蛋白质鉴定结果，因此，分析仪器的测量误差并予以校准非常重要。

实验室的环境，如温度湿度等，对质谱的测量精度影响很大，即使在测量样品之前对仪器进行校准，使之达到5ppm的精度，但在测量实际样品时，测量误差能高达100ppm以上，因此还需识别实际样品的测量误差。一般情况下，在同一仪器、同一时间、同一环境下测量的样品，样品里单个质谱间的测量误差相差很大，但样品的所有质谱的测量误差接近于一个正态分布，其平均值和标准差大抵能描述整个样品中质谱测量误差的分布。

在实际测量中往往使用内部标准参考物(简称为内标)或外部标准参考物(简称为外标)来识别实际样品测量的误差并对质谱进行校准。文献“K.L.Johnson，C.J.Mason，D.C.Muddiman，and J.E.Eckel，Analysis of the Low Molecular WeightFraction of Serum by LC-Dual ESI-FT-ICR Mass Spectrometry，Precision of RetentionTime，Mass，and Ion Abundance，Anal.Chem.，2004，76，5097-5103.”和“M.J.Chalmers，J.P.Quinn，G.T.Blakney，M.R.Emmett，H.Mischak，S.J.Gaskell，and A.G.Marshall，Liquid Chromatography-Fourier Transform Ion Cyclotron Resonance MassSpectrometric Characterization of Protein Kinase C Phosphorylation，J.Proteome Res.，2003，2，373-382.”中公开的内标法，是在样品中加入一定量的质量已知的物质作为内部标准，通过每个质谱中所包含的内部标准物的测量值与理论值的差异来判断质谱的测量误差并予以校正。也有使用胰蛋白酶自切形成的离子峰作为内部校准的，见参考文献“T.Rejtar，H.S.Chen，V.Andreev，E.Moskovets，and B.L.Karger，IncreasedIdentification of Peptides by Enhanced Data Preprocessing of High-Resolution

MALDI TOF/TOF Mass Spectra Prior to Database Searching，Anal.Chem.，2004，76，6017-6028.”。内标法的优点是准确性高，但存在样品间交叉污染的可能性，且内标的高峰可能使样品信号被抑制，见参考文献“J.Preisler，P.Hu，T.Rejtar，andB.L.Karger，Capillary Electrophoresis-Matrix-Assisted Laser Desorption/IonizationTime-of-Flight Mass Spectrometry Using a Vacuum Deposition Interface，Anal.Chem.，2000，72，4785-4795.”。