[发明专利]Ljungan病毒的检测方法无效
申请号: | 200680008229.3 | 申请日: | 2006-03-15 |
公开(公告)号: | CN101194026A | 公开(公告)日: | 2008-06-04 |
发明(设计)人: | B·尼克拉森;A·尼奇;O·多诺索-曼特克;M·尼德里格 | 申请(专利权)人: | 阿波德漠斯有限公司;罗伯特-科赫研究所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70 |
代理公司: | 北京北翔知识产权代理有限公司 | 代理人: | 张广育;姜建成 |
地址: | 瑞典*** | 国省代码: | 瑞典;SE |
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摘要: | |||
搜索关键词: | ljungan 病毒 检测 方法 | ||
1.一种检测LV的方法,包括检测一段核酸序列,所述核酸序列包括序列:
CTGCRYAGGTGGCTTTCACCTCTSGACAGYGC(SEQ ID NO.1)或其反向互补序列中的至少13个连续的核苷酸。
2.根据权利要求1的方法,其中所述待检测的核酸序列是一段RNA序列。
3.根据权利要求1的方法,其中所述待检测的核酸序列是一段DNA序列。
4.根据权利要求1的方法,包括将LV RNA反转录成cDNA的起始步骤。
5.根据前述权利要求任一项的方法,其中所述被检测的核酸序列包括SEQID NO.1或其反向互补序列中的至少15个连续的核苷酸。
6.根据前述权利要求任一项的方法,其中所述被检测的核酸序列包括SEQID NO.1或其反向互补序列中的至少17个连续的核苷酸。
7.根据前述权利要求任一项的方法,其中所述被检测的核酸序列包括以下序列:GCTTTCACCTCTSGACA(SEQ ID NO.3)或其反向互补序列。
8.根据前述权利要求任一项的方法,其中使用至少一个带标记的探针检测所述核酸序列,所述的标记探针能与SEQ ID NO.1或其反向互补序列的至少13个连续的核苷酸特异性地杂交。
9.根据权利要求8的方法,其中所述带标记的探针的长度小于25个核苷酸。
10.根据权利要求8的方法,其中所述带标记的探针的长度为17个核苷酸或更小。
11.根据权利要求8-10中任一项的方法,其中所述带标记的探针结合到所述被检测核酸的小沟。
12.根据权利要求8-11中任一项的方法,其中所述探针为单链DNA探针。
13.根据权利要求8至11中任一项的方法,其中所述探针为外切核酸酶探针。
14.根据权利要求4的方法,其中一段DNA引物退火至所述RNA序列的某个位置,使得能够产生一段包括SEQ ID NO.1中的至少13个连续的核苷酸的DNA序列,并且所述引物通过反转录酶的作用进行延伸。
15.权利要求14的方法,其中所述引物具有如下序列:
GCCCAGAGGCTAGTGTTACCA(SEQ ID NO.9)。
16.根据权利要求1的方法,包括:
(a)反转录LV RNA,从而得到一段包括SEQ ID NO.1中的至少13个连续的核苷酸的DNA序列;
(b)扩增所述DNA序列;并且
(c)检测所述扩增出的DNA序列的存在。
17.根据权利要求16的方法,其中用探针检测所述扩增出的DNA序列。
18.根据权利要求16或17的方法,其中用聚合酶链反应(PCR)扩增所述DNA序列。
19.根据权利要求18的方法,其中所述用于PCR反应的引物能扩增出一段包括SEQ ID NO.1中的至少13个连续的核苷酸的DNA序列。
20.根据权利要求19的方法,其中所述引物包括:
一段正向引物,包括序列:TAGGGGCTGTACCCGGGCGGTCCCACTCTTCACAG(SEQ ID NO.7)或其中至少13个连续的核苷酸;并且一段反向引物,包括序列:
CCCCTAGTGGTAACACTAGCCTCTGGGCCCAAAAGGCATGTC(SEQ ID NO.8)或其中至少13个连续的核苷酸。
21.根据权利要求20的方法,其中所述正向引物具有如下序列:
GCGGTCCCACTCTTCACAG(SEQ ID NO.12)。
22.根据权利要求20或21的方法,其中所述反向引物具有如下序列:
TGGTAACACTAGCCTCTGGGC(SEQ ID NO.9)。
23.根据权利要求18至22中任一项的方法,其中进行定量PCR。
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