[发明专利]探针阵列以及探针阵列的制造方法

说明书

技术领域

本发明涉及将探针保持为阵列状的探针阵列及其制造方法，更详细地说涉及具有多个阵列区域的探针阵列、其分隔用隔板、探针阵列的制造方法、以及核酸杂交方法等。

背景技术

在采用玻璃基板的一般DNA微阵列中，正尝试在每一个基板上形成多个阵列区域(每个阵列区域都是固定多个探针的探针固定区域)，以同时处理多个被测体。杂交是在具有多个阵列区域的玻璃基板上放置一片盖玻片而进行的，这种方法存在邻近的阵列区域的反应液(含有目标物的溶液)互相混合的问题。因此，例如，特开2002-65274中公开了在分隔阵列区域的分隔壁上赋予疏水性，并使阵列区域内具有亲水性，使反应液保持在阵列区域内，避免发生混合。

根据图19所示，对于在基板上保持DNA微阵列等多个探针的阵列，通常，为将探针固定在基板表面上而进行表面处理后，通过喷墨法等各种方式向基板表面供给探针，随后为将探针固定在基板表面上而进行固定化处理。要形成分隔为多个阵列区域的疏水性区域，采用印刷或化学处理，但是要将这样形成的疏水性区域固定在基板上，要求数百度的高温以及要把基板浸渍在预定液体中，成为探针的核酸和蛋白质等生物物质和表面处理有可能变差。因此，以往的技术如图19所示，在表面处理和点样(spotting)之前先进行疏水性区域的形成工序，对预先形成了疏水性区域的基板上的未形成疏水性区域的区域进行表面处理，随后进行点样。

发明内容

但是，根据本发明人的研究，明确了如果在预先形成疏水性区域的基板上进行表面处理、使探针点样、固定化，则由疏水性区域分隔的阵列区域内杂交反应的均匀性有比以往降低的倾向。在由通过印刷和涂覆等形成的疏水性区域而分隔的阵列区域内，也存在杂交反应效率降低的倾向。进一步研究时，明确了这样的杂交上的不良情况的一个原因是阵列区域表面的化学性质不均匀。

这样的具有多个阵列区域的阵列，在待测液的阵列区域间，待测液的污染是一个大问题。例如，在阵列区域滴下待测液后，将阵列收容在预定的反应室中，再放入预定条件的培养箱等中，随着上述阵列的移送，容易产生污染。

而且，在具有多个阵列区域的阵列，识别各阵列区域、识别特定的阵列时存在困难。

因此，本发明的一个目的是提供具有表面化学性状均匀的被分隔的阵列区域的探针阵列。本发明的另一个目的是提供具有被分隔的阵列区域的探针阵列，所述阵列区域能实现杂交等探针与待测液的良好反应。此外，本发明的另一个目的是提供能抑制或避免阵列区域间污染的探针阵列。本发明的另一个目的是提供能在基板上的任意区域形成上述阵列区域的探针阵列的制造技术，本发明的另一个目的是提供阵列区域的识别性优良的探针阵列。

本发明的发明者们对上述问题的研究结果发现，为分隔阵列区域而在基板的表面处理之前进行疏水性区域的形成处理、或疏水性区域的存在，使得阵列区域的表面化学性状不均匀，其结果是，表面处理不均匀，并且探针位点的形状和大小不均匀、进而固定化量不均匀，这个结果使杂交等的相互作用反应的偏差也增大。特别是发现在邻近疏水区域的阵列区域的边缘部分也发生这样的不均匀。因此，本发明的发明者们获得了如下能解决以往问题的知识：排除通过向基板表面印刷和化学处理而进行的疏水性区域的形成工序，同时对进行过表面处理的基板安装具有能分隔出阵列区域的隔壁的隔板，从而完成了本发明。根据本发明，能够提供下述方法。

根据本发明的一种方式，能提供一种探针阵列，其基板上具有被分隔的、固定了多个探针的1个以上的阵列区域，在上述基板上安装具有分隔出1个以上上述阵列区域的隔壁的隔板。对于本发明，探针优选核酸探针。探针也优选蛋白质探针。上述阵列区域优选多个。

根据上述方式，上述隔板也可以安装在上述基板上固定上述探针的探针固定化层表面，在这种情况下，优选上述隔板在上述探针固定化后安装在上述探针固定化层表面。

上述隔板优选为片状，优选通过粘接层固定在基板上。并且，上述隔板也优选以能与上述基板分离的方式固定。

并且，上述隔板的至少一部分也可以具有疏水性区域。对于这种形式，优选在上述隔板的上述隔壁的顶面上具有上述疏水性区域。这样形成的疏水性区域的水接触角优选为60°以上。更优选为70°以上。上述疏水性区域可以含有选自聚碳酸酯、聚烯烃、聚酰胺、聚酰亚胺和丙烯酸树脂及这些物质的氟化物和卤化物中的材料。

由上述隔板的分隔上述阵列区域的隔壁围成的区域，能构成开放空腔，该空腔用于上述探针与待测试验在上述阵列区域上的相互作用。