[发明专利]单链引物-启动子-选择子构建体的IVT的应用无效
申请号: | 200680041636.4 | 申请日: | 2006-09-21 |
公开(公告)号: | CN101589154A | 公开(公告)日: | 2009-11-25 |
发明(设计)人: | 迈克尔·休;娜塔莉亚·科泽瓦 | 申请(专利权)人: | 佰尔瑞溶液有限公司 |
主分类号: | C12P19/34 | 分类号: | C12P19/34 |
代理公司: | 北京安信方达知识产权代理有限公司 | 代理人: | 杨淑媛;郑 霞 |
地址: | 美国新*** | 国省代码: | 美国;US |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 引物 启动子 选择 构建 ivt 应用 | ||
1.一种用于检测样品中靶标子序列的存在或相对量的引物-启动子- 选择子构建体,其包括以下三个子序列:
与所述靶标子序列互补的引物子序列,其5’末端与启动子子序列3’ 末端相邻,所述启动子子序列能够引导选择子子序列的转录,所述选择子 子序列3’末端与所述启动子子序列的5’末端相邻,其中所述选择子子序列 和其互补序列被设计为不与所述样品中预期存在的任何子序列退火。
2.如权利要求1的构建体,其中所述启动子不引导所述引物子序列 的转录。
3.如权利要求1的构建体,其中所述启动子为T7或T3或SP6启动 子子序列。
4.如权利要求1的构建体,其中所述引物子序列能与模板退火和延 伸。
5.如权利要求1的构建体,其包括可识别的标签。
6.如权利要求1的构建体,其中所述选择子子序列作为体外转录的 模板。
7.一种试剂盒,其包括:多种不同类型的引物-启动子-选择子构建体 和一组寡核苷酸,
其中所述构建体各自用于检测样品中不同靶标子序列的存在或相对 量,所述构建体各自包括以下三个子序列:与所述靶标子序列互补的引物 子序列,其5’末端与启动子子序列3’末端相邻,所述启动子子序列能够引 导选择子子序列的转录,所述选择子子序列3’末端与所述启动子子序列的 5’末端相邻;
其中具有不同序列的所述寡核苷酸展示在不同编码的微颗粒上,并且 其中所述寡核苷酸能够与所述选择子子序列的转录产物退火。
8.如权利要求7的试剂盒,其中所述不同类型的构建体各自的引物 子序列和选择子子序列不同。
9.如权利要求8的试剂盒,其中每个类型的构建体有不同的引物子 序列和相同的选择子子序列。
10.如权利要求7的试剂盒,其还包括能够掺入所述转录产物的经标 记的NTP。
11.如权利要求10的试剂盒,其中所述NTP是光学标记的。
12.如权利要求7的试剂盒,其中所述启动子为T7或T3或SP6启动 子子序列(模板链)。
13.如权利要求12的试剂盒,其还包括能够与所述T7、T3或SP6启 动子子序列形成双链体的非模板T7、T3或SP6启动子子序列。
14.如权利要求7的试剂盒,其还包括一组不同编码的微颗粒,所述 微颗粒适合结合不同类型的与所述转录产物互补的寡核苷酸。
15.如权利要求7的试剂盒,其还包括一组经标记的ddNTP或dNTP, 所述经标记的ddNTP或dNTP被设计用于在所述引物子序列延伸时掺入延 伸产物。
16.如权利要求7的试剂盒,其还包括半抗原标记的ddNTP或dNTP。
17.如权利要求16的试剂盒,其还包括磁性颗粒。
18.如权利要求7的试剂盒,其还包括能够与所述样品中子序列退火 的寡核苷酸,该寡核苷酸定位至引物的靶向子序列的3’端或定位至所述引 物。
19.如权利要求18的试剂盒,其中所述寡核苷酸是经标记的。
20.如权利要求18的试剂盒,其中所述寡核苷酸包括所述启动子子 序列。
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