[发明专利]含有磷酸酯模拟物的多聚核苷酸有效
申请号: | 200680043667.3 | 申请日: | 2006-09-12 |
公开(公告)号: | CN101312985A | 公开(公告)日: | 2008-11-26 |
发明(设计)人: | D·海因德尔;D·克斯勒 | 申请(专利权)人: | 霍夫曼-拉罗奇有限公司 |
主分类号: | C07H21/00 | 分类号: | C07H21/00 |
代理公司: | 中国专利代理(香港)有限公司 | 代理人: | 程淼;黄可峻 |
地址: | 瑞士*** | 国省代码: | 瑞士;CH |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 含有 磷酸酯 模拟 核苷酸 | ||
1.含有至少一次以下结构的化合物
其中A表示核苷酸或核苷酸链的5′端,以及
B表示核苷酸或核苷酸链的3′端
D是OH或CH3,以及
Acc是电子受体且选自由以下组成的组
(i)-CN,
(ii)-SO2-R′,其中R′是至少一个氨基取代的烷基,任选地取代的 芳基或任选地取代的杂环,
(iii)具有至少一个位于邻位或对位的烷基化N-原子的六元N+- 杂环,所述杂环选自由吡啶嘧啶和喹啉组成的组。
2.如权利要求1所述的化合物,其特征在于R′单独或者与所述电 子受体一起含有可检测单元或官能团。
3.如权利要求1或2所述的化合物,其特征在于A和B一起含 有至少两个核苷酸残基。
4.制备经修饰的寡聚核苷酸的方法,其特征在于具有以下化学结 构的三价磷衍生物
其中,E表示或者甲基或者受保护的羟基,
其中A表示核苷酸或核苷酸链的5′端和
其中B表示核苷酸或核苷酸链的3′端,
与具有以下结构的叠氮化物进行反应,
N=N=N-Acc
其中Acc是电子受体且选自由以下组成的组
(i)-CN,
(ii)-SO2-R′,其中R′含有至少一个氨基取代的烷基,任选地取代 的芳基或任选地取代的杂环,
(iii)具有至少一个位于邻位或对位的烷基化N-原子的六元N+- 杂环,所述杂环选自由吡啶嘧啶和喹啉组成的组。
5.如权利要求4所述的方法,包括以下步骤
a)将3′亚磷酰胺与新生成的寡聚核苷酸链的5′OH端进行反应
b)与具有以下结构的叠氮化物反应
N=N=N-Acc
其中Acc是电子受体且选自由以下构成的组
(i)-CN,
(ii)-SO2-R′,其中R′含有至少一个氨基取代的烷基,任选地取代 的芳基或任选地取代的杂环,
(iii)具有至少一个位于邻位或对位的烷基化N-原子的六元N+- 杂环,所述杂环选自由吡啶嘧啶和喹啉组成的组。
6.如权利要求4或5所述的方法,其中R′是可检测单元。
7.如权利要求1~3任一项所述的寡聚核苷酸作为杂交对象的周 途。
8.如权利要求1~3任一项所述的寡聚核苷酸作为杂交探针的用 途。
9.如权利要求1~3任一项所述的寡聚核苷酸在细胞培养实验中 阻止基因表达的用途。
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