[发明专利]减少核酸杂交中Cot-1 DNA畸变的发生

权利要求书

1.一种抑制核酸探针中存在的重复序列与靶基因组核酸中同源重复序列之间非特异性交叉杂交的方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：

鉴定代表性基因组区域中的重复序列；

合成衍生自所鉴定的重复序列的抑制性核酸，所述抑制性核酸基本上含有所鉴定的重复序列且基本上没有低拷贝序列；和

使所述抑制性核酸与靶核酸反应，从而导致所述抑制性核酸中的重复序列与所述靶核酸中的同源重复序列杂交，

由此所述靶核酸中的所述重复序列基本上不与后续的反应性核酸探针中的同源重复序列杂交，从而抑制了所述探针中的所述重复序列与所述靶核酸中的同源重复序列之间的非特异性交叉杂交。

2.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述靶核酸含有低拷贝序列。

3.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述合成的抑制性核酸含有选出的与一个或多个代表性基因组区域中的毗邻低拷贝序列的重复序列相对应的多个重复序列。

4.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述合成的抑制性核酸完全没有低拷贝序列。

5.如权利要求1所述的方法，其特征在于，还包括使所述靶核酸与一个或多个探针杂交的步骤，此种探针含有与所述靶核酸中的低拷贝序列同源的低拷贝序列。

6.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述探针基本上没有重复序列。

7.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述探针完全没有重复序列。

8.如权利要求1所述的方法，其特征在于，还包括将所述探针与光谱编码的聚苯乙烯微球偶联的步骤。

9.如权利要求1所述的方法，其特征在于，包括用可检测部分标记所述探针的步骤。

10.如权利要求9所述的方法，其特征在于，所述部分选自：荧光团、酶偶联物、荧光团标签核苷酸、与携带抗原的核苷酸结合的荧光标记抗体、生物素-dUTP、地高辛-dUTP和它们的组合。

11.如权利要求1所述的方法，其特征在于，在试验中利用所述抑制性核酸来封闭所述重复序列，所述试验选自微阵列杂交试验、荧光原位杂交试验和微球体杂交试验。

12.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述抑制性核酸包含一种或多种序列明确的PCR产物，它们选自：短散布元件、长散布元件、长末端重复序列、Alu元件、L1元件和DNA转座子。

13.一种合成抑制性核酸的方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：

鉴定代表性基因组区域中的重复序列；和

通过合成能与所鉴定的重复序列杂交但不与所述代表性基因组区域附近或其中的低拷贝序列杂交的核酸序列来合成所述抑制性核酸。

14.如权利要求13所述的方法，其特征在于，所述合成的抑制性核酸基本上没有低拷贝序列。

15.如权利要求13所述的方法，其特征在于，还包括根据它们与感兴趣低拷贝序列的相邻性选择某些经鉴定的重复序列来合成所述抑制性核酸。

16.如权利要求15所述的方法，其特征在于，所述某些经鉴定的重复序列是最靠近所述感兴趣低拷贝序列的那些序列。

17.如权利要求15所述的方法，其特征在于，所述合成的抑制核酸不含能与所述感兴趣低拷贝序列杂交的序列。

18.如权利要求13所述的方法，其特征在于，还包括在杂交试验中采用所述合成的抑制性核酸的步骤。

19.如权利要求18所述的方法，其特征在于，所述杂交试验选自：荧光原位杂交试验，微阵列试验和微球体杂交试验。

20.一种提高低拷贝数核酸探针与靶核酸中同源区域之间杂交特异性的方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：

使所述靶核酸中的重复元件与抑制性核酸中的同源重复元件杂交，所述抑制性核酸包含多个重复元件且基本上不含低拷贝数元件；和

使所述靶核酸中的低拷贝数元件与一个或多个所述核酸探针中的同源低拷贝数元件杂交。