[发明专利]微阵列方法无效
申请号: | 200680052374.1 | 申请日: | 2006-12-29 |
公开(公告)号: | CN101336301A | 公开(公告)日: | 2008-12-31 |
发明(设计)人: | M·J·西蒙斯 | 申请(专利权)人: | 西蒙斯单倍体有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;G01N33/53;G06F17/00 |
代理公司: | 上海专利商标事务所有限公司 | 代理人: | 韦东 |
地址: | 中国香港湾仔轩尼诗路48*** | 国省代码: | 中国香港;81 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 阵列 方法 | ||
1.一种能鉴定一组相关核苷酸序列中某成员的微阵列探针组的鉴定方法, 该方法包括以下步骤:提供候选探针组,其包含至少一种能与该相关核苷酸序 列组中的两个或多个成员差异杂交的探针;检测该探针组与相关核苷酸序列组 中两个或多个成员的反应性;以及观察该探针组与该相关核苷酸序列组中两个 或多个成员反应性模式的差异程度。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述反应性模式的差异程度足 够充分,从而该相关核苷酸序列组的几乎所有成员都显示出独特反应性模式, 所述候选探针组是信息探针组。
3.如权利要求1或权利要求2所述的方法,其特征在于,该相关核苷酸序 列组的各成员获自或衍生自两种或多种生物。
4.如权利要求1-3中任一项所述的方法,其特征在于,有关该相关核苷酸 序列组成员或者获得或衍生出该成员的生物的遗传特征或遗传连锁特征是已 知的,从而所述独特反应性模式为存在或不存在所述遗传特征或遗传连锁特征 提供了信息。
5.如权利要求1-4中任一项所述的方法,其特征在于,所述候选探针组是 通过包括将该相关核苷酸序列组中各成员的核苷酸序列分成多个亚序列的方 法制造的,其中至少2个亚序列重叠且其中所述候选探针组针对该亚序列。
6.如权利要求5所述的方法,其特征在于,至少有3个亚序列相互重叠。
7.如权利要求5所述的方法,其特征在于,至少有4个亚序列相互重叠。
8.如权利要求1所述的方法,其特征在于,至少有5个亚序列相互重叠。
9.如权利要求5所述的方法,其特征在于,所述重叠是完全重叠。
10.如权利要求1-9中任一项所述的方法,其特征在于,所述相关序列的 不同之处在于存在一个或多个核苷酸多态性。
11.如权利要求10所述的方法,其特征在于,所述核苷酸多态性为单核苷 酸多态性。
12.如权利要求1-11中任一项所述的方法,其特征在于,所述亚序列为探 针长度。
13.如权利要求1-12中任一项所述的方法,其特征在于,所述亚序列的长 度约10-50个核苷酸。
14.如权利要求1-12中任一项所述的方法,其特征在于,所述亚序列的长 度约15-35个核苷酸。
15.如权利要求1-12中任一项所述的方法,其特征在于,所述亚序列的长 度约25个核苷酸。
16.如权利要求1-15中任一项所述的方法,其特征在于,所有亚序列的长 度相同或类似。
17.如权利要求1-16中任一项所述的方法,其特征在于,所述相关核苷酸 序列的序列相同性为至少50%、60%、70%、80%、90%、95%或99%。
18.如权利要求1-17中任一项所述的方法,其特征在于,所述相关序列显 示含有高密度的SNP。
19.如权利要求1-18中任一项所述的方法,其特征在于,所述相关序列是 蛋白质编码序列、非编码序列、或蛋白质编码序列或非编码序列的组合。
20.如权利要求1-19中任一项所述的方法,其特征在于,所述相关序列针 对基因组的同一区域。
21.如权利要求1-20中任一项所述的方法,其特征在于,所述相关核苷酸 序列是某基因的等位基因。
22.如权利要求1-21中任一项所述的方法,其特征在于,所述相关核苷酸 序列组中相关核苷酸序列的数目大于100、200、300、400、500、600、700、 800、900或1000。
23.如权利要求1-22中任一项所述的方法,其特征在于,所述相关核苷酸 序列是涉及免疫系统的基因座的一部分。
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