[发明专利]一种香菇135菌种的分子标记及其获得方法与应用无效
申请号: | 200710040351.5 | 申请日: | 2007-04-29 |
公开(公告)号: | CN101078029A | 公开(公告)日: | 2007-11-28 |
发明(设计)人: | 宋春艳;谭琦;陈明杰;尚晓冬;潘迎捷 | 申请(专利权)人: | 上海市农业科学院食用菌研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11;C12P19/34;G01N27/447 |
代理公司: | 上海泰能知识产权代理事务所 | 代理人: | 黄志达;谢文凯 |
地址: | 201106*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 香菇 135 菌种 分子 标记 及其 获得 方法 应用 | ||
1.一种香菇135菌种的分子标记,其特征在于:特异性PCR扩增引物对序列为5’CCTGTGACAATCAAGCTGGAAC 3’与5’AGGTCACCGTCGTCGTTGTTGT 3’;DNA片断大小为601bp。
2.一种香菇135菌种的分子标记的获得方法,包括如下步骤:
(1)菌丝培养和基因组DNA的提取;
(2)香菇菌株135的特异DNA片断的获得;
(3)特异PCR扩增引物的获得;
(4)SCAR分子标记的PCR扩增;
(5)电泳检测。
3.如权利要求2所述的一种香菇135菌种的分子标记的获得方法,其特征在于:所述步骤(2)中香菇菌株135的特异DNA片断是通过采用PCR技术,经过大量的筛选试验,在采用随机引物获得,分子量为650bp,将该片段克隆测序。
4.如权利要求3所述的一种香菇135菌种的分子标记的获得方法,其特征在于:所用随机引物序列为:CAATCGCCGT。
5.如权利要求2所述的一种香菇135菌种的分子标记的获得方法,其特征在于:所述步骤(3)中特异PCR扩增引物通过下列方法获得:以得到的DNA序列为基础,设计特异PCR扩增引物,引物对的序列如下:5’CCTGTGACAATCAAGCTGGAAC 3’和5’AGGTCACCGTCGTCGTTGTTGT 3’。
6.如权利要求2所述的一种香菇135菌种的分子标记的获得方法,其特征在于:所述步骤(1)中菌丝培养和基因组DNA的提取包括下列步骤:将低温保藏的香菇菌种转接到PDA斜面上,25℃培养活化。两周后接到100mL PD液体培养基中,25℃100r/min振荡培养两周,收集菌丝,放入-20℃冰箱冻存;用改进的CTAB法提取基因组DNA,DNA稀释至20ng/μL,-20℃冰箱贮藏备用。
7.如权利要求2所述的一种香菇135菌种的分子标记的获得方法,其特征在于:所述步骤(4)中SCAR分子标记的PCR扩增:扩增体系总体积为:25μL,扩增体系:10×PCR buffer2.5μL,25mmol/L MgCL2 2μL,10mmol/L dNTP 0.25L,2.5U/μL Taq DNA酶0.5μL,10μmol/L 135菌株检测专用引物对各1μL,模板DNA 1μL(浓度1ng~10ng/μL),ddH2O18.6μL,PCR反应条件:94℃ 1min;94℃ 15second,61℃ 15second,72℃ 1min,30个循环;72℃5min。
8.如权利要求2所述的一种香菇135菌种的分子标记的获得方法,其特征在于:所述步骤(4)中SCAR分子标记的PCR扩增反应体系中加入ITS(Internal Transcribed Spacer),通用引物对(ITS1、ITS4)。
9.如权利要求2所述的一种香菇135菌种的分子标记的获得方法,其特征在于:所述步骤(5)电泳检测为:取步骤(4)PCR扩增产物8μL,与1μL加样缓冲液混匀,点样于1.5%的琼醋糖凝胶上,于0.5×TBE缓冲液中,5V/cm电压下电泳,电泳结束后,用EB染色,然后在凝胶成像仪上照相。
10.一种香菇135菌种的分子标记应用于香菇135菌种的快速鉴定和检测。
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