[发明专利]一种检测糖尿病肾病血清标本中差异表达的蛋白质谱的方法无效
申请号: | 200710046224.6 | 申请日: | 2007-09-20 |
公开(公告)号: | CN101393165A | 公开(公告)日: | 2009-03-25 |
发明(设计)人: | 胡仁明;杨叶虹 | 申请(专利权)人: | 复旦大学附属华山医院 |
主分类号: | G01N27/64 | 分类号: | G01N27/64;G01N33/68 |
代理公司: | 上海正旦专利代理有限公司 | 代理人: | 吴桂琴 |
地址: | 200031*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 糖尿病肾病 血清 标本 差异 表达 蛋白质 方法 | ||
1、一种检测糖尿病肾病血清标本中差异表达的蛋白质谱的方法,其特征在 于采用表面加强激光解吸电离飞行时间质谱技术,联合应用蛋白质芯片技术和分 子标志物模式软件建立树状分析模式,检测分析血清标本中蛋白质谱的差异表 达,包括下述步骤,
(1)血清标本进行蛋白裂解预处理;
(2)用弱阳离子芯片处理血清标本;
(3)芯片经上样、缓冲液平衡后加能量吸收分子SPA;
(4)处理后的芯片经PBS芯片阅读仪分析获得蛋白质图谱;
(5)比较不同组间血清蛋白质谱的差异;
(6)建立糖尿病肾病的分析决策树模型;
(7)应用树状分析模式获得有差异的蛋白质峰。
2、按权利要求1所述的检测糖尿病肾病血清标本中差异表达的蛋白质谱的 方法,其特征在于所述的弱阳离子芯片是WCX2的芯片。
3、按权利要求1所述的检测糖尿病肾病血清标本中差异表达的蛋白质谱的 方法,其特征在于所述的获得蛋白质图谱的参数是:
检测最高分子量为100000道尔顿,激光强度为185,检测灵敏度为8,检测 点20-80。
4、按权利要求2所述的方法,其特征在于所述的获得蛋白质图谱的参数, 其中检测分子量是2000~20000道尔顿。
5、按权利要求1所述的检测糖尿病肾病血清标本中差异表达的蛋白质谱的 方法,其特征在于,采用软件Biomarker Wizard Software 3.1,比较不同组间 血清蛋白质谱的差异,其中内参照共有蛋白的m/z为6634.8,蛋白峰范围: 2000-100000道尔顿;蛋白质峰归类信噪比S/N为5。
6、、按权利要求1所述的检测糖尿病肾病血清标本中差异表达的蛋白质谱的 方法,其特征在于,所述的决策树模型是由6个蛋白质组成的7个节点的决策树 模型。
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