[发明专利]创伤弧菌的一管法半巢式PCR检测试剂盒及检测方法无效
申请号: | 200710100758.2 | 申请日: | 2007-04-17 |
公开(公告)号: | CN101082063A | 公开(公告)日: | 2007-12-05 |
发明(设计)人: | 谢珍玉;周永灿;冯永勤 | 申请(专利权)人: | 海南大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 海口翔翔专利事务有限公司 | 代理人: | 莫臻 |
地址: | 570228海南*** | 国省代码: | 海南;66 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 创伤 弧菌 一管法半巢式 pcr 检测 试剂盒 方法 | ||
1、一种一管法半巢式PCR检测试剂盒,其特征在于,包括:
(1)DNA提取试剂:含缓冲试剂A和细胞裂解试剂B;试剂A含有NaCl 200~350mmol/L,ph=8.0的三羟甲基氨基甲烷50~100mmol/L,乙二胺四乙酸二钠50~100mmol/L;试剂B含有浓度为5~10%的十二烷基磺酸钠水溶液;
(2)聚合酶链式反应试剂:包括反应预混试剂C和反应引物试剂D和E;试剂C包括10×反应缓冲液5μL、500~1000μmol L-1的dNTPs、1~5m mol L-1的MgCl2,1~2个单位的热聚合酶和适量的灭菌超纯水;试剂D包括引物Vvg1和Vvg2,浓度均为5~20μmol L-1,
Vvg1特指5’-CATCGTGGTGGTCATACTCATAGC-3’;
Vvg2特指5’-GGTGCTCGGCTAAGAAGTCGTT-3’;
试剂E包括引物Vvg3,其浓度为10~30μmol L-1,
Vvg3特指5’-AAGACGGGATTGCGGTTGAAGT-3’;
(3)电泳和显色试剂,包括试剂F、试剂G、试剂H和试剂I;试剂F:为20-50倍电泳缓冲液,含三羟基甲基氨基甲烷-醋酸和乙二胺四乙酸二钠,浓度分别为0.01~0.04mol/L和0.001mol/L;
试剂G:含0.1~0.5g琼脂糖;
试剂H:Nucleic acid ClearDNA stain;
试剂I:标准分子量DL2000。
2、一种使用权利要求1中的试剂盒检测创伤弧菌的方法,其特征在于,包括下列步骤:
1)样品处理:取1~5ml水样样品,用50~1000μL试剂A悬浮样品,并将样品充分混匀,1000~3000g离心3~10分钟,取上清转管,8000~15000g离心3~10分钟,弃上清;
2)DNA提取:用50~150μL试剂A再次悬浮沉淀,并加入5~10μL试剂B,混匀,室温放置5分钟以上,沸水浴中保温10~30分钟;8000~15000g离心10分钟,取上清转管,并加入上清2/3体积的异丙醇;混匀后室温放置10分钟,8000~15000g离心5分钟;去上清,75%乙醇洗涤一次,让乙醇彻底挥发,将沉淀溶于10~50μL灭菌双蒸水,即制成了DNA提取液;
3)聚合酶链式反应扩增:取0.5~2μL DNA提取液和40~45μL试剂C、1~2μL试剂D混合;在热循环仪上按以下方法进行扩增:首先以94℃预变性1~4min;接着以92~95℃变性0.5~2min,62℃退火0.5~2min,72℃延伸0.5~2min,共扩增5~15个循环;加入1~2μL试剂E,以92~95℃变性0.5~2min,62℃退火0.5~2min,72℃延伸0.5~2min,再扩增20~40个循环;最后72℃延伸5~10min,4℃保存;
4)电泳和显色检测:将试剂F稀释成1倍的电泳缓冲液,取10~40mL的1倍电泳缓冲液和试剂G充分混匀后煮沸,用10cm×10cm的核酸水平电泳槽制胶,凝固后加入适量的1倍电泳缓冲液,使液面高于胶面0.5~2mm;取5~20μL扩增后的样品与0.8~4μL试剂H在保鲜膜上混合,静置5~10min以上,将此混合样品加于上述胶孔中,同时,在另一胶孔中加入1~5μL的试剂I;50~100V电泳20~30min;紫外光下检测,如果同时有一条700核苷酸对和一条350的核苷酸对条带,说明样品已被创伤弧菌感染或污染;如果样品中只有一条350核苷酸对条带,则需要用引物Vvg1和Vvg3做另一扩增反应实验,如果样品中能产生一条700核苷酸对的条带,同样说明样品有创伤弧菌感染或污染;反之则没有。
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