[发明专利]基于分子结构快速筛选环境有机污染物雄激素的方法无效
申请号: | 200710134051.3 | 申请日: | 2007-10-26 |
公开(公告)号: | CN101140289A | 公开(公告)日: | 2008-03-12 |
发明(设计)人: | 肖乾芬;王晓栋;刘树深;杨旭曙;季力;尹大强;王连生 | 申请(专利权)人: | 南京大学 |
主分类号: | G01N35/00 | 分类号: | G01N35/00;G06F19/00 |
代理公司: | 南京知识律师事务所 | 代理人: | 汪旭东 |
地址: | 210093*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 分子结构 快速 筛选 环境 有机 污染物 激素 方法 | ||
1.一种基于分子结构快速筛选环境有机污染物雄激素的方法,其主要包括以下步骤:
(A)化合物按结构进行分类,从文献中获得113个有实验数据LogRBA值及其结构的化合物;并利用ChemOffice软件画出所有化合物的二维和三维结构,按含有类苯环类化合物的结构特征,根据结构相似性原理将化合物按结构进行分类,将含有苯环化合物按结构分成了具有代表性的6类化合物,其各类化合物的母环结构如下:
(B)利用Dragon软件分别计算这6类化合物的结构信息参数;
(C)在分好的每一类化合物中随机抽取训练组和检验组;
(D)将各类化合物中计算所得的结构信息参数、对应的LogRBA值和活性分类数据转导入SPSS软件,利用逐步判别分析方法对各类化合物中的训练组进行QSAR模型建立,并得到各类化合物的QASAR模型判别函数及类别重心,即:
1)Y1=84.027PW3+1.349LOP-28.772 其重心分别为:2--0.467;3 1.635
2)此类化合物共12个雄激素,活性均属第二类2--弱活性,不必建立判别函数,可以直接判断;
3)Y3=7.492NS+2.641TI2-7.535 重心分别为2--0.761;3-4.822;
4)Y4=2.106IDE-1.587IDDE 重心分别为2-0.504;3-1.614;
5)Y5=151.969PW4-25.506 重心分别为2-0.420;3--2.102;
6)Y6=1912JHETV-0.702Maxdp-1.522 重心分别为2--0.541;3-1.760;
(E)对于含有类苯环类的有机化合物,根据结构判断是属于所分成的6类结构中的哪一类,若属于第①类,则根据第①类的判别函数和类别重心来进行判断,若属于第②类,则根据第②类的判别函数和类别重心来进行判断,依次类推;
(F)再算出该化合物对应结构类中判别函数里所含的参数值,并将参数值带入判别函数进行计算,得到Y值,再计算Y值与各类别重心的差,即欧氏距离d,按距离最小原则判归到最近的类中;1类为强活性,其LogRBA值大于等于零,2类为弱活性,其LogRBA值在0~-4之间,3类为无活性,其LogRBA值小于等于-4,若是属于第1、2类,则说明该化合物是环境雄激素,若是属于第3类,则说明该化合物不是环境雄激素。
2.根据权利要求1所述的基于分子结构快速筛选环境有机污染物雄激素的方法,其特征在于步骤(C)每一类化合物绝大多数分到训练组,检验组主要是检验所建的模型是否达到了预期的目的,所以一般同一类化合物中不同活性的各留1-2个化合物在检验组即可。
3.根据权利要求1或2所述的基于分子结构快速筛选环境有机污染物雄激素的方法,其特征在于步骤(B)中结构信息参数包括拓扑特征、几何特征、电子特征,理化特性共266个参数。
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