[发明专利]鱼类种质资源遗传分析装置无效

专利信息
申请号: 200710144749.3 申请日: 2007-12-05
公开(公告)号: CN101251873A 公开(公告)日: 2008-08-27
发明(设计)人: 匡友谊;孙效文;尹家胜 申请(专利权)人: 中国水产科学研究院黑龙江水产研究所
主分类号: G06F19/00 分类号: G06F19/00;G06F9/44
代理公司: 哈尔滨市松花江专利商标事务所 代理人: 王吉东
地址: 150070黑龙*** 国省代码: 黑龙江;23
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摘要:
搜索关键词: 鱼类 种质 资源 遗传 分析 装置
【权利要求书】:

1、鱼类种质资源遗传分析装置,其特征在于它由以下部分组成:

用于将指定的由分子标记检测获得的电泳图谱转换成0,1矩阵的Excel格式的分子标记文件的数据输入装置;

用于设置数据分析处理步骤及各步骤的处理参数形成工程文件,进而为调用装置提供工作顺序流程的工程建立装置;

用于将数据输入装置获得的0,1矩阵的Excel格式的分子标记文件转换成分析装置中各个分析软件模块需要的输入格式文件的格式转换装置;

用于根据工程建立装置形成的工程文件调用分析装置中的分析软件模块的调用装置;

用于对分子标记数据进行分析的数据分析装置;

其中所述数据分析装置包括:

用于完成哈代温博格平衡、群体分化、连锁不平衡、基因流参数分析的Genepop模块;

用于对基因频率、基因型频率、等位基因数目、杂合度、群体自交系数及遗传分化、基因流参数进行分析的PopGene模块;

用于处理包括核酸序列、分子标记数据、包括形态学数据在内的离散或连续分布的数据,完成鱼类种质资源的群体或品种演化相关分析的Phylip模块;

用于完成鱼类种质资源遗传群体的确定及群体、个体的亲缘分配,获得群体迁徙路线、群体分化程度、群体演化结果分析的Structure模块。

2、根据权利要求1所述的鱼类种质资源遗传分析装置,其特征在于所述Genepop模块中包括多个用于获得一种数据分析结果的Genepop功能模块,还包括用于根据工程建立装置形成的工程文件调用相应Genepop功能模块的Genepop批处理模块。

3、根据权利要求1所述的鱼类种质资源遗传分析装置,其特征在于所述Phylip模块中包括多个用于获得一种数据分析结果的Phylip功能模块,还包括用于设置各个Phylip功能模块的工作参数的Phylip参数设置模块;用于根据工程建立装置形成的工程文件调用相应Phylip功能模块的Phylip批处理模块。

4、根据权利要求1所述的鱼类种质资源遗传分析装置,其特征在于所述格式转换装置由以下装置组成:

用于将0,1矩阵的Excel格式的分子标记文件转换成PopGene模块输入格式的分子标记文件的E-Po格式转换装置;

用于将0,1矩阵的Excel格式的分子标记文件转换成GenePop模块输入格式的分子标记文件的E-Ge格式转换装置;

用于将0,1矩阵的Excel格式的分子标记文件转换成Phylip模块输入格式的分子标记文件的E-Ph格式转换装置;

用于将0,1矩阵的Excel格式的分子标记文件转换成Structure模块输入格式的分子标记文件的E-St格式转换装置。

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