[发明专利]诱变处理的确认方法及其所用核酸分子无效
申请号: | 200710151815.X | 申请日: | 2007-09-18 |
公开(公告)号: | CN101153339A | 公开(公告)日: | 2008-04-02 |
发明(设计)人: | 梶田昌裕;山本宪明;酒井绫子;石原英幹 | 申请(专利权)人: | 希森美康株式会社 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 北京金之桥知识产权代理有限公司 | 代理人: | 梁朝玉;刘良勇 |
地址: | 日本兵库县神户市*** | 国省代码: | 日本;JP |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 诱变 处理 确认 方法 及其 所用 核酸 分子 | ||
1.一种确认让来源于生物的DNA的未甲基化胞嘧啶变为胞嘧啶以外碱基的诱变处理是否适当的方法,包括以下步骤:
将从所述生物采集的DNA与在所述生物基因组中未包含的、且含有胞嘧啶的序列A的精度管理用核酸混合的步骤;
将获得的混合液中未甲基化胞嘧啶变为胞嘧啶以外碱基的步骤;
检测所述序列A或上述序列A中的胞嘧啶突变为所述其他碱基序列的序列A’的步骤;以及
根据所述检测结果判断所做所述诱变处理是否适当的步骤。
2.根据权利要求1所述方法,其中,所述检测步骤用于检测所述序列A和所述序列A’。
3.根据权利要求2所述方法,其中,所述检测步骤用可与所述序列A杂交的多核苷酸和可与所述序列A’杂交的多核苷酸检测所述序列A和所述序列A’。
4.根据权利要求2所述方法,其中,
当所述序列A中的胞嘧啶含未甲基化胞嘧啶、
在所述检测步骤中检出上述序列A’时,则所述判断步骤判断上述诱变步骤适当。
5.根据权利要求2所述方法,其中,
当所述序列A中的胞嘧啶含甲基化胞嘧啶、
在所述检测步骤中检出上述序列A时,则所述判断步骤判断上述诱变步骤适当。
6.根据权利要求1所述方法,其中,
所述精度管理用核酸还有所述生物基因组未含有的、且不含未甲基化胞嘧啶的序列B。
7.根据权利要求6所述方法,还包括以下步骤:
所述诱变步骤后用可与序列B杂交的多核苷酸定量所述精度管理用核酸;及
根据所述定量结果和前述混合步骤中使用的精度管理用核酸的量,计算所述诱变步骤后从生物采集的DNA的回收率。
8.一种核酸分子,至少包含以下序列之一:
(a)序列号1的核苷酸序列;
(b)序列号1的核苷酸序列中至少有一个核苷酸被置换、缺失、插入或加成、且人类基因组不含的核苷酸序列;
(C)序列号2的核苷酸序列;及
(d)序列号2的核苷酸序列中至少有一个核苷酸被置换、缺失、插入或加成、且人类基因组不含的核苷酸序列。
9.根据权利要求8所述核酸分子,包含:
所述(a)或所述(b)的核苷酸序列;及
所述(C)或所述(d)的核苷酸序列。
10.根据权利要求8所述核酸分子,还包含至少以下序列当中的一个:
(e)序列号3的核苷酸序列;及
(f)序列号3的核苷酸序列中至少有一个核苷酸被置换、缺失、插入或加成、且人类基因组不含的核苷酸序列,
(G)序列号4的核苷酸序列;及
(h)序列号4的核苷酸序列中至少有一个核苷酸被置换、缺失、插入或加成、且人类基因组不含的核苷酸序列。
11.根据权利要求10所述核酸分子,包含:
所述(e)或所述(f)的核苷酸序列;及
所述(G)或所述(h)的核苷酸序列。
12.一种用于对将采自生物的DNA的未甲基化胞嘧啶变为胞嘧啶以外的其他碱基的诱变处理进行确认的试剂盒,包括:
具有所述生物基因组中未含有的、且含有胞嘧啶的序列A的精度管理用核酸;及
可与所述序列A杂交的多核苷酸和可与所述序列A中的胞嘧啶变为所述其他碱基序列时的序列A’杂交的多核苷酸中的至少一种。
13.根据权利要求12所述试剂盒,其中前述精度管理用核酸有下列所述序列A中的至少一种:
(a)序列号1的核苷酸序列;
(b)序列号1的核苷酸序列中至少有一个核苷酸被置换、缺失、插入或加成、且人类基因组不含的核苷酸序列;
(C)序列号2的核苷酸序列;及
(d)序列号2的核苷酸序列中至少有一个核苷酸被置换、缺失、插入或加成、且人类基因组不含的核苷酸序列。
14.根据权利要求13所述试剂盒,其中前述精度管理用核酸有下列所述序列A:
所述(a)或所述(b)的核苷酸序列;及
所述(C)或所述(d)的核苷酸序列。
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