[发明专利]利用特异基因序列鉴别药用灵芝的检测方法无效
申请号: | 200710170772.X | 申请日: | 2007-11-22 |
公开(公告)号: | CN101200769A | 公开(公告)日: | 2008-06-18 |
发明(设计)人: | 周选围;林娟;李琦章;尹燡周;唐克轩 | 申请(专利权)人: | 上海交通大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 上海交达专利事务所 | 代理人: | 王锡麟;王桂忠 |
地址: | 200240*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 利用 特异 基因 序列 鉴别 药用 灵芝 检测 方法 | ||
1.一种利用特异基因序列鉴别药用灵芝的检测方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)购回的市售药用灵芝菌株,保藏和培养;
(2)将培养好的药用灵芝菌丝体经洗涤沉淀,研磨成粉末状;
(3)药用灵芝DNA的提取和纯化;
(4)药用灵芝特异基因序列的序列测定、PCR产物的电泳检测和限制性内切酶酶切产物的电泳检测;
(5)从药用灵芝的菌丝中扩增出的336bp和721bp的特异性条带,通过进一步的序列测定和酶切电泳,发现差异,利用差异进行鉴别;
(6)从药用灵芝菌丝中分别扩增出580bp、495bp和836bp的特异性条带,通过电泳检测,发现差异,利用差异进行鉴别,判定检测结果。
2.根据权利要求1所述的利用特异基因序列鉴别药用灵芝的检测方法,其特征是,步骤(3)中所述的药用灵芝DNA的提取和纯化,采用高盐低pH提取法提取基因组DNA,包括以下步骤:
①经液氮研磨的样品放入65℃预热的提取缓冲液,放入65℃水浴保温30min,不时缓慢振摇,室温下10,000×g离心10min;
②在上清液中加入2/3体积的KAc高盐溶液,混匀后置于0℃保持30min以沉淀蛋白质;
③在4℃下10,000×g离心10min,弃蛋白质沉淀,上清液加入等体积的氯仿/异戊醇抽提,在6,000×g离心10min,取出水相转入另一离心管,
如果中间层仍有白色沉淀,则再用氯仿/异戊醇抽提一次;
④在上清液中加入2/3体积的预冷异丙醇,混匀后置于-20℃静置30min,以沉淀核酸,可以重复一次,用70%乙醇清洗沉淀,在空气中干燥50min,将DNA沉淀溶解在合适体积的TE缓冲液中,分装存放于-20℃或4℃冰箱中保存。
3.根据权利要求1所述的利用特异基因序列鉴别药用灵芝的检测方法,其特征是,步骤(5)中所述的从所选药用灵芝的菌丝中扩增出的336bp和721bp的特异性条带,设计了两对引物序列:
第1对:FIP A:5’-ATGTCCGACACTGCCTTGATCTTCAGG-3’和FIP B:5’-CTAGTTCCACTGGGCGATGATGAAGTC-3’;
第2对:FIPGF:5’-CTGTGGCTTGCAGGGCCTCGCAC-3’和FIPGR:5’-CTTGTCTCATAATCATGCCCGTG-3’。
4.根据权利要求1所述的利用特异基因序列鉴别药用灵芝的检测方法,其特征是,步骤(5)中所述的从所选的药用灵芝菌丝中均能扩增出的336bp和721bp的特异性条带,是指:以提取的药用灵芝菌丝DNA为模板,使用引物FIP A和FIP B,进行标准程序的PCR扩增,从药用灵芝来源的赤灵芝、紫芝和松杉灵芝菌丝中均能扩增出336bp大小的特异性条带;使用引物FIPGF和FIPGR,进行标准程序的PCR扩增,从赤灵芝、紫芝和松杉灵芝中也均能扩增出721bp大小的特异性条带。
5.根据权利要求1所述的利用特异基因序列鉴别药用灵芝的检测方法,其特征是,步骤(6)中所述的从药用灵芝菌丝中分别扩增出580bp、495bp和836bp的特异性条带,设计了三对引物序列:
第1对:FIPGLUF:5’-GGGGTTGCATCC-AGGTCCACCTG-3’和FIPGLUR:5’-CGCTATGCCATACCCGGAGTTG-3’;
第2对:FIPGSIF:5’-GGGGTTGCATCC-AGGTCCACCTG-3’和FIPGSIR:5’-ACCCCAACAGGTTCGTCGACAACG-3’;
第3对:FIPGTSF:5’-TACGAGGGTTTCACGCCGAGGTTC-3’和FIPGTSR:5’-AAACTCGGCCGCGATAGAGAAGCA-3’。
6.根据权利要求1所述的利用特异基因序列鉴别药用灵芝的检测方法,其特征是,步骤(6)中所述的从药用灵芝菌丝中分别扩增出580bp、495bp和836bp的特异性条带,是指:以提取的药用灵芝菌丝DNA为模板,使用引物FIPGLUF和FIPGLUR只能从赤灵芝中扩增得到580bp大小的特异性条带;使用引物FIPGSIF和FIPGSIR只能从紫芝中扩增出495bp大小的特异性条带;使用引物FIPGTSF和FIPGTSR只能从松杉灵芝中扩增出836bp大小的特异性条带。
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