[发明专利]玉米多态性和基因分型的方法

权利要求书

1.多态性玉米DNA基因座，其用于至少两个玉米品种之间的基因 分型：其中所述的基因座包含至少20个连续的核苷酸，其包括或与表1 中鉴定的多态性相邻；并且其中所述的至少20个连续的核苷酸的序列 与玉米DNA片段的任一条链中的相同核苷酸数量的序列至少90％同一， 所述的玉米DNA片段包括或与所述的多态性相邻。

2.用于检测玉米DNA中的多态性的分离的核酸分子，其中所述的 核酸分子包含至少12个核苷酸碱基和可检测的标记，并且其中所述的 至少12个核苷酸碱基的序列与包含所述的多态性的权利要求1的基因 座中的玉米DNA片段的任一条链中的相同连续核苷酸数量的序列至少 90％同一。

3.寡核苷酸的组，包含：

(a)核酸分子引物对，其中所述引物各自包含至少15个核苷酸 碱基并且其中所述引物对用于根据权利要求1的多态性玉米DNA基因座 片段的PCR扩增，其中所述的片段包含多态性；和

(b)至少一种检测子核酸分子，其用于检测所述片段中的多态 性，其中所述的检测子核酸包含

(1)至少12个核苷酸碱基和可检测的标记，或

(2)至少15个核苷酸碱基，

其中所述的检测子核酸分子的序列与包含所述多态性的权利要求 1的基因座中的玉米DNA片段的任一条链中的相同连续核苷酸数量的序 列至少95％同一。

4.一种发现玉米DNA中的多态性的方法，包括比较至少两种玉米 品系中的DNA序列，其中所述的序列通过使用权利要求1的基因座的片 段进行选择。

5.根据权利要求4的方法，其中所述的序列选择为与所述的基因座 连锁。

6.一种基因分型的方法，包括测定来自至少一种玉米品系的组织的 DNA或mRNA，以鉴定与权利要求1的基因座连锁的核酸多态性的存在。

7.根据权利要求6的基因分型的方法，其中所述的多态性是表3中 鉴定的已定位的多态性。

8.根据权利要求6的方法，其进一步包括鉴定至少两种玉米品系的 一种或多种表型性状和确定所述性状和多态性之间的关联。

9.根据权利要求6的方法，其中鉴定和选择具有互补性状的品系用 于育种，以提高杂种优势。

10.根据权利要求6的方法，其中所述的测定使用足够的核酸分子 以鉴定至少高达限定数量的不同多态性的存在，其中所述的限定数量选 自10、25、40、75、100、500、1000、2000、3000、4000和5000。

11.一种研究玉米等位基因的方法，包括确定分离自一种或多种玉 米植物的核酸分子的核酸序列中的多态性的存在，其中所述的多态性与 权利要求1的基因座连锁。

12.一种定位玉米基因组序列的方法，包括鉴定所述序列中的已定 位的多态性的存在，其中所述的已定位的多态性与权利要求1的基因座 连锁。

13.根据权利要求12的方法，其中所述的已定位的多态性鉴定于表 3中。

14.一种对玉米育种的方法，包括选择具有多态性的玉米品系，所 述多态性通过连锁不平衡与目的性状关联，其中所述的多态性与权利要 求1的基因座连锁。

15.一种在玉米中将表型性状与基因型关联的方法，包括：

(a)鉴定表征所述玉米植物的一种或多种不同表型性状的组；

(b)选择来自至少两种具有等位基因DNA的玉米植物的组织，并且 测定来自所述组织的DNA或mRNA以鉴定不同多态性的组的存 在或缺失。

(c)鉴定所述多态性的组和所述表型性状的组之间的关联，

其中所述的多态性的组包含至少一个与权利要求1的基因座连锁的多态 性。

16.根据权利要求15的在玉米中将表型性状与基因型关联的方法， 其中所述的多态性的组包含至少10个多态性，其与表3中鉴定的已定 位的多态性连锁。