[发明专利]合成和纯化寡核苷酸的化合物和方法有效

专利信息
申请号: 200780044741.8 申请日: 2007-12-21
公开(公告)号: CN101547928A 公开(公告)日: 2009-09-30
发明(设计)人: A·P·古普塔;S·G·威尔 申请(专利权)人: 霍夫曼-拉罗奇有限公司
主分类号: C07F9/02 分类号: C07F9/02;C07H21/04
代理公司: 中国专利代理(香港)有限公司 代理人: 马崇德;付 磊
地址: 瑞士*** 国省代码: 瑞士;CH
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摘要:
搜索关键词: 合成 纯化 寡核苷酸 化合物 方法
【权利要求书】:

1.具有式(I)的化合物:

            PR1R2R3

              (I)

其中R1选自C1-C8烷氧基,其任选被CN取代;

R2是-N(i-Pr)2

R3具有式-O-(CH2)m(CF2)pCF3;m是1、2、3、4、5、6、7、8、9 或10,和p是1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、 16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29或30;

并且其中烷基是指直链饱和烃部分。

2.权利要求1的化合物,其中R1是-OCH3

3.权利要求1的化合物,其中R1是-OCH2CH2CN。

4.权利要求1的化合物,其中m是3,和p是5。

5.权利要求1的化合物,其中m是3,和p是7。

6.抑制寡核苷酸延长的方法,该方法包括:在用或不用催化剂的条 件下,使寡核苷酸与一种化合物接触,所述化合物具有式(I):

              PR1R2R3

                (I)

其中R1选自C1-C8烷氧基,其任选被CN取代;

R2是-N(i-Pr)2

R3具有式-O-(CH2)m(CF2)pCF3;m是1、2、3、4、5、6、7、8、9 或10,和p是1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、 16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29或30;

并且其中烷基是指直链饱和烃部分。

7.制备包含X个核苷酸的修饰的寡核苷酸的方法,其中X是至少 为3的整数;该方法包括:

(a)使每个包含X-n个核苷酸单元的许多寡核苷酸与修饰的核苷酸 或核苷接触,其中n是1至X-1的整数;和

(b)使(a)的未反应产物与封端试剂接触,封端试剂包括具有式(I)的 化合物:

                    PR1R2R3

                      (I)

其中R1选自C1-C8烷氧基,其任选被CN取代;

R2是-N(i-Pr)2

R3具有式-O-(CH2)m(CF2)pCF3;m是1、2、3、4、5、6、7、8、9 或10,和p是1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、 16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29或30;

其中烷基是指直链饱和烃部分。

8.一种组合物,其包含至少一种权利要求1至5的化合物。

9.制备核酸的试剂盒,其包含至少一种权利要求1至5的化合物和 下列中的至少一种:(a)至少一种可延长的单体;(b)至少一种固体载体; (c)至少一种用于延长寡核苷酸的催化剂;(d)至少一种缓冲液;(e)至少 一套指示用试剂盒的组分来延长寡核苷酸的说明书;和(f)至少一个用于 包装试剂盒组分的容器。

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