[发明专利]线粒体测序用26对PCR引物及基于该引物的分型方法无效
申请号: | 200810017975.X | 申请日: | 2008-04-15 |
公开(公告)号: | CN101270390A | 公开(公告)日: | 2008-09-24 |
发明(设计)人: | 李生斌;刘清波;赖江华;张洪波;杨丽 | 申请(专利权)人: | 西安交通大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 西安通大专利代理有限责任公司 | 代理人: | 惠文轩 |
地址: | 710049*** | 国省代码: | 陕西;61 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 线粒体 测序用 26 pcr 引物 基于 方法 | ||
1、线粒体测序用26对PCR引物,包括
引物1 1F CTCCTCAAAGCAATACACTG 3′结合位点611
1R TGCTAAATCCACCTTCGACC 3′结合位点1411
引物2 2F CGATCAACCTCACCACCTCT 3′结合位点1245
2R TGGACAACCAGCTATCACCA 3′结合位点2007
引物3 3F GGACTAACCCCTATACCTTCTGC 3′结合位点1854
3R GGCAGGTCAA TTTCACTGGT 3′结合位点2669
引物4 4F AAATCTTACCCCGCCTGTTT 3′结合位点2499
4R AGGAATGCCATTGCGATTAG 3′结合位点3346
引物5 5F TACTTCACAAAGCGCCTTCC 3′结合位点3169
5R ATGAAGAATAGGGCGAAGGG 3′结合位点3961
引物6 6F TGGCTCCTTTAACCTCTCCA 3′结合位点3796
6R AAGGATTATGGATGCGGTTG 3′结合位点4854
引物7 7F ACTAATTAATCCCCTGGCCC 3′结合位点4485
7R CCTGGGGTGGGTTTTGTATG 3′结合位点5420
引物8 8F CTAACCGGCTTTTTGCCC 3′结合位点5255
8R ACCTAGAAGGTTGCCTGGCT 3′结合位点6031
引物9 9F GAGGCCTAACCCCTGTCTTT 3′结合位点5855
9R ATTCCGAAGCCTGGTAGGAT 3′结合位点6642
引物10 10F CTCTTCGTCTGATCCGTCCT 3′结合位点6469
10R AGCGAAGGCTTCTCAAATCA 3′结合位点7315
引物11 11F ACGCCAAAATCCATTTCACT 3′结合位点7148
11R CGGGAATTGCATCTGTTTTT 3′结合位点8095
引物12 12F ACGAGTACACCGACTACGGC 3′结合位点7937
12R TGGGTGGTTGGTGTAAATGA 3′结合位点8797
引物13 13F TTTCCCCCTCTATTGATCCC 3′结合位点8621
13R GTGGCCTTGGTATGTGCTTT 3′结合位点9397
引物14 14F CCCACCAATCACATGCCTAT 3′结合位点9230
14R TGTAGCCGTTGAGTTGTGGT 3′结合位点10130
引物17 17F TCACTCTCACTGCCCAAGAA 3′结合位点11314
17R GGAGAATGGGGGATAGGTGT 3′结合位点12076
引物18 18F TATCACTCTCCTACTTACAG 3′结合位点11948
18R AGAAGGTTATAATTCCTACG 3′结合位点12772
引物19 19F AAACAACCCAGCTCTCCCTAA 3′结合位点12571
19R TCGATGATGTGGTCTTTGGA 3′结合位点13507
引物20 20F ACATCTGTACCCACGCCTTC 3′结合位点13338
20R AGAGGGGTCAGGGTTCATTC 3′结合位点14268
引物21 21F GCATAATTAAACTTTACTTC 3′结合位点14000
21R AGAATATTGAGGCGCCATTG 3′结合位点14998
引物22 22F TGAAACTTCGGCTCACTCCT 3′结合位点14856
22R AGCTTTGGGTGCTAATGGTG 3′结合位点15978
引物23 23F TCATTGGACAAGTAGCATCC 3′结合位点15811
23R GAGTGGTTAATAGGGTGATAG 3′结合位点5
其特征在于,还包括:
引物15-1 15-1F CTTCTATTGATGAGGGTCTT 3′结合位点9991
15-1R GGTGTTGAGGGTTATGAGA 3′结合位点10622
引物15-2 15-2F AAGGATTAGACTGAACCGAA 3′结合位点10404
15-2R CTGATTGTGAGGGGTAGGA 3′结合位点10992
引物15-3 15-3F CAACCACCCACAGCCTAA 3′结合位点10857
15-3R TTGAGAATGAGTGTGAGGCG 3′结合位点11512
引物24-1 24-1F CATTATCCCGCACAAGAGTG 3′结合位点16419
24-1R TGGAAAGTGGCTGTGCAGACAT 3′结合位点250
引物24-2 24-2F CTTTGATTCCTGCCTCATCC 3′结合位点132
24-2R TAGAAAGGCTAGGACCAAACCT 3′结合位点652
该26对PCR引物覆盖了线粒体基因组全长,其中引物15-1、15-2、15-3、24-1、24-2对中国人群的分型具有针对性。
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