[发明专利]食源性致病菌分子检测标记的建立方法无效
申请号: | 200810032391.X | 申请日: | 2008-01-08 |
公开(公告)号: | CN101343662A | 公开(公告)日: | 2009-01-14 |
发明(设计)人: | 刘战民;尹京苑 | 申请(专利权)人: | 上海大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04 |
代理公司: | 上海上大专利事务所(普通合伙) | 代理人: | 何文欣 |
地址: | 200444*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 食源性 致病菌 分子 检测 标记 建立 方法 | ||
1、一种食源性致病菌分子检测标记的建立方法,其特征在于该方法的具体步骤为:
a.收集一种食源性致病菌的所有基因组序列;
b.选取步骤a中获得的基因组序列中的任一基因组切分成长度为500~1000bp的片段,将每个切分片段与其余的基因组序列进行比对,保留相似性达到98%以上的切分片段,得到保守序列片段;
c.将步骤b获得的保守序列片段中的任一片段与其他微生物基因组序列进行比对,剔除保守序列片段中与其他微生物基因组序列相同的片段,则保留下来的序列片段即为该食源性致病菌的特异性标记群;
d.将步骤c获得的特异性标记群中的数据信息进行筛选,得到食源性致病菌分子检测标记。
2、根据权利要求1所述的食源性致病菌分子检测标记的建立方法,其特征在于所述的食源性致病菌是指经食品引起人类患病的细菌、真菌、病毒或类病毒。
3、根据权利要求1或2所述的食源性致病菌分子检测标记的建立方法,其特征在于所述的食源性致病菌为:金黄色葡萄球菌、单核增生李斯特、沙门氏杆菌、副溶血弧菌、耐热核酸酶基因、表皮剥脱毒素基因、中毒性休克综合症毒素基因、耐甲氧西林基因、16S-23SrRNA或肠出血性大肠埃希氏菌的hly、slt、eae基因。
4、根据权利要求1所述的食源性致病菌分子检测标记的建立方法,其特征在于所述的食源性致病菌的所有基因组序列是从DDBJ、EMBL、NCBI以及TIGR的数据库中获得。
5、根据权利要求1所述的食源性致病菌分子检测标记的建立方法,其特征在于基因组序列进行比对采用的比对软件为BLAST。
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