[发明专利]一个能辨别海带雌配子体的SCAR分子标记有效
申请号: | 200810038220.8 | 申请日: | 2008-05-29 |
公开(公告)号: | CN101280339A | 公开(公告)日: | 2008-10-08 |
发明(设计)人: | 周志刚;刘艳省;吴文凯;李利华 | 申请(专利权)人: | 上海海洋大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/29;C12N15/11;C12N15/10 |
代理公司: | 上海正旦专利代理有限公司 | 代理人: | 陆飞;盛志范 |
地址: | 200090*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一个 辨别 海带 配子体 scar 分子 标记 | ||
1、一种能辨别海带雌配子体的SCAR分子标记,其特征在于为F-494,其序列为SEQ IDNO.4。
2、一种用于海带雌配子体基因组DNA扩增引物对,其特征在于该引物对的序列为SEQID NO.3。
3、一种能辨别海带雌配子体的SCAR分子标记的提取方法,其特征在于具体步骤如下:
(1)在17±1℃、30-40μmol m-2s-1光照条件下培养海带雌、雄性配子体无性繁殖系,收集材料并提取配子体基因组DNA;
(2)根据地钱Y染色体保守区域碱基序列设计引物SEQ ID NO.1,利用此引物分别对海带雌、雄配子体基因组DNA进行PCR扩增,PCR产物用1.0%的琼脂糖凝胶电泳,溴化乙锭染色,凝胶成像系统进行观察和拍照;
(3)回收特异扩增片段的DNA,利用pMD19-T载体、大肠杆菌感受态菌株JM109,进行克隆,挑选白色菌落,使用PCR确认载体中插入片段的长度大小,将含有目的片段的菌液进行测序,得SEQ IDNO.2;
(4)根据测序结果,将原正向引物向3’端及反向引物向5’端延长至29个碱基,获得SCAR特异引物的序列SEQ ID NO.3,对海带雌、雄配子体基因组DNA进行PCR扩增,扩增结果在1.5%的琼脂糖凝胶上进行电泳,凝胶成像系统进行观察与拍照;
(5)按照步骤(3)进行DNA胶回收、连接转化、白色菌落筛选、插入片段的长度大小确认等,最后对含有目的片段的菌液进行测序,获得一个能鉴别海带雌配子体的SCAR分子标记,它的DNA序列为SEQ ID NO.4。
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