[发明专利]钠磷转运体DvSPT2基因诱导型启动子、其克隆方法及其应用无效
申请号: | 200810040039.0 | 申请日: | 2008-07-01 |
公开(公告)号: | CN101302525A | 公开(公告)日: | 2008-11-12 |
发明(设计)人: | 许政暟;宋任涛;厉高慜;张文文;卢彬;孟祥宗;管祯玮 | 申请(专利权)人: | 上海大学 |
主分类号: | C12N15/31 | 分类号: | C12N15/31;C12N15/10 |
代理公司: | 上海上大专利事务所(普通合伙) | 代理人: | 何文欣 |
地址: | 200444*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 转运 dvspt2 基因 诱导 启动子 克隆 方法 及其 应用 | ||
1.一种钠磷转运体DvSPT2基因诱导型启动子,其特征在于该基因具有下列核苷酸序列之一:
(1).具有SEQ NO 1所示的DNA序列;
(2).与序列表中序列1限定的核酸序列具有95%以上的同源性,且编码相同功能蛋白质的DNA序列。
2.一种根据权利要求1所述的钠磷转运体DvSPT2基因诱导型启动子的克隆方法,其特征在于该方法的具体步骤为:
a.根据NCBI GenBank上DvSPT2的cDNA序列,即DQ286761,设计引物,引物的序列如下:
5′-AGAACCTGAGCGGCTTCATC-3′
5′-CACGCAGCAATGAAGGAGGT-3′
通过四维PCR筛选体系从盐藻基因组BAC文库得到一个含有盐藻钠磷共转运通道2号基因DvSPT2的BAC克隆,并构建该BAC克隆的鸟枪文库;
b.大通量提取鸟枪文库的质粒DNA,在MegaBACE 4500上进行序列的测定,每个鸟枪质粒利用M13正反向引物,进行双向测序;
c.在RedHat Linux平台的并联计算机群中,使用Phred/Phrap/Consed程序拼接所测序列,得到若干长短不一的重叠群Contig;使用PCR方法填补测序“沟”,使用细菌转座子Kit填补物理“沟”,最后拼接得到一段连续的全长为64776bp的盐藻基因组序列,DvSPT2基因组序列的启动子和上游调控序列也一并获得,以开放读码框第一位碱基为基准,向5′上游方向划定1500bp,即为钠磷转运体DvSPT2基因诱导型启动子。
3.一种根据权利要求1所述的钠磷转运体DvSPT2基因诱导型启动子在盐胁迫以及磷缺乏条件下的基因调控中的应用。
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