[发明专利]用于检测指状青霉菌对抑霉唑抗性频率的引物序列及其检测方法无效
申请号: | 200810062320.4 | 申请日: | 2008-05-08 |
公开(公告)号: | CN101270384A | 公开(公告)日: | 2008-09-24 |
发明(设计)人: | 陈广进;李红叶 | 申请(专利权)人: | 浙江大学 |
主分类号: | C12Q1/18 | 分类号: | C12Q1/18;C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 杭州天勤知识产权代理有限公司 | 代理人: | 胡红娟 |
地址: | 310027浙*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 青霉 抑霉唑 抗性 频率 引物 序列 及其 方法 | ||
1.一种用于检测指状青霉菌对抑霉唑抗性频率的引物序列,其特征在于:包括三组引物,第一组引物的正向引物具有序列表中SEQ ID NO.1所述的碱基序列,第一组引物的反向引物具有序列表中SEQ ID NO.2所述的碱基序列;第二组引物的正向引物具有序列表中SEQ ID NO.3所述的碱基序列,第二组引物的反向引物具有序列表中SEQ ID NO.4所述的碱基序列;第三组引物的正向引物具有序列表中SEQ ID NO.5所述的碱基序列,第三组引物的反向引物具有序列表中SEQ ID NO.4所述的碱基序列。
2.一种指状青霉菌对抑霉唑抗性频率的检测方法,包括以下步骤:
(1)提取指状青霉菌对抑霉唑的敏感菌株、抗性类型I菌株、抗性类型II菌株以及被测菌的DNA;
(2)将敏感菌株、抗性类型I菌株和抗性类型II菌株的DNA稀释制成若干个浓度梯度,分别加入第一组引物、第二组引物和第三组引物,进行real-time PCR扩增,得到分别用于检测指状青霉菌总DNA量、抗性类型I菌株DNA量和抗性类型II菌株DNA量的标准曲线;
(3)取等量的3组被测菌DNA,分别加入第一组引物、第二组引物和第三组引物,同时进行三组real-time PCR扩增,分别根据用于检测指状青霉菌总DNA量、抗性类型I菌株DNA量和抗性类型II菌株DNA量的标准曲线,得到被测菌中指状青霉菌总DNA量QT、抗性类型I菌株DNA量QR-I和抗性类型II菌株DNA量QR-II;
(4)计算样品中指状青霉菌对抑霉唑抗性频率FR(DNA)=(QR-I+QR-II)/QT。
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