[发明专利]一种克隆多拷贝T-DNA旁侧植物DNA序列的方法有效
申请号: | 200810064648.X | 申请日: | 2008-06-02 |
公开(公告)号: | CN101285084A | 公开(公告)日: | 2008-10-15 |
发明(设计)人: | 景天忠;王志英;齐凤慧 | 申请(专利权)人: | 东北林业大学;景天忠;王志英 |
主分类号: | C12P19/34 | 分类号: | C12P19/34;C12N15/10 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 150040黑龙*** | 国省代码: | 黑龙江;23 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 克隆 拷贝 dna 旁侧 植物 序列 方法 | ||
1、一种克隆转基因植物中多拷贝T-DNA旁侧植物DNA序列方法,包括以下步骤:
(1)常规方法提取转基因植物基因组DNA。
(2)对步骤1中所述的DNA进行酶切反应。
(3)常规方法将步骤(2)中所述的酶切产物分离为两部分,回收大于5kb的片段部分。
(4)以步骤(3)中所述的回收片段为模板,进行TAIL-PCR扩增2轮。
(5)按常规方法纯化、克隆步骤(4)中所述的TAIL-PCR产物。使用PCR法筛选阳性克隆后常规方法进行测序,得到T-DNA旁侧的植物DNA序列。
2、根据权利要求1所述的方法,其特征在于:酶切反应既可以是单酶切,也可以是双酶切。
3、根据权利要求2所述的方法,其特征在于:单酶切既可以在NOS poly A区进行,也可以在35S polyA区进行,双酶切为同时在NOS polyA和35S polyA区进行。
4、根据权利要求3所述的方法,其特征在于:在NOS poly A区进行酶切的限制性内切酶为AflII、TfiI、BslI、HpaII,以及它们的同功酶。在35S poly A区进行酶切的限制性内切酶为MslI、AquI、XhoI、McrI、PvuI,以及它们的同功酶。
5、根据权利要求3所述的方法,其特征在于:用SmlI酶在NOS poly A区和35S poly A区同时切割。
6、根据权利要求1所述的方法,其特征在于:扩增T-DNA右边界旁侧植物DNA时,在2轮TAIL-PCR中所用嵌套引物为具有序列表中序列1和序列2的单链寡核苷酸序列;扩增T-DNA左边界旁侧植物DNA时,在2轮TAIL-PCR中所用嵌套引物为具有序列表中序列4和序列5的单链寡核苷酸序列。
7、根据权利要求1所述的方法,其特征在于:测序前用PCR法筛选阳性克隆。对于T-DNA右边界旁侧植物DNA的克隆,所用引物为具有序列表中序列2和序列3的单链寡核苷酸序列;对于T-DNA左边界旁侧植物DNA的克隆,所用引物为具有序列表中序列5和序列6的单链寡核苷酸序列。
8、根据权利要求1、2、3、4、5、6、7所述的方法,其特征在于:既可以是含有单拷贝T-DNA的转基因植物,也可以是含有多拷贝T-DNA的转基因植物。
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