[发明专利]一种用于限制片段长度多态性研究的家蚕DNA抽提方法无效

专利信息
申请号: 200810096857.2 申请日: 2008-05-07
公开(公告)号: CN101314774A 公开(公告)日: 2008-12-03
发明(设计)人: 李兵;沈卫德;许雅香;卫正国;陈玉华 申请(专利权)人: 苏州大学
主分类号: C12N15/10 分类号: C12N15/10;C12P19/34
代理公司: 苏州创元专利商标事务所有限公司 代理人: 陶海锋
地址: 215123江苏省*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 用于 限制 片段 长度 多态性 研究 家蚕 dna 方法
【说明书】:

技术领域

发明涉及一种家蚕DNA的抽提方法,具体涉及到一种适合于限制片段长 度多态性研究的家蚕DNA抽提方法。

背景技术

限制片段长度多态性(Restriction Fragment Length Polymorphism, RFLP)已被广泛用于基因组遗传图谱构建、基因定位以及生物进化和分类的研 究。这一技术的开展需要以个体作为研究对象,即需要抽提出个体内高纯度和 高浓度的DNA,用于RFLP的相关研究。

家蚕(Bombyx mori L.)是重要的经济昆虫,也是用于遗传学及分子生物 学研究的模式昆虫。现有技术中,提取家蚕的DNA用于RFLP研究的技术主要 有以下几种:

(1)常规的DNA抽提方法:是将家蚕整头一起进行研磨。

由于蚕体含有大量蛋白、脂类及色素,抽提出的DNA纯度较低(OD260/280< 1.8),进行RFLP检测时,限制性酶切往往切不彻底,不能进行RFLP研究。

(2)将多头家蚕的后部丝腺混在一起进行DNA抽提。

虽然DNA的量是达到了RFLP研究的要求,但RFLP的研究需要DNA样品来 源于个体而不是群体。

(3)目前国内有些实验室也尝试从家蚕个体后部丝腺抽提DNA做RFLP,但 由于传统的抽提方法在抽提过程DNA损失量过大,只有10μg左右,不能对结 果进行重复试验,DNA的样就用完了。

要开展对个体作为研究对象的RFLP检测,需要优化DNA的抽提方法,抽 提出高质量(OD260/280>1.9)的足够多(100μg以上)的DNA样品。

发明内容

本发明目的是提供一种适合于限制片段长度多态性研究的家蚕DNA抽提 方法,该方法能够抽提出高质量,高纯度的家蚕DNA样品用于RFLP研究。

为达到上述目的,本发明采用的技术方案是:一种适合于限制片段长度多 态性研究的家蚕DNA抽提的方法,包括解剖家蚕取出后部丝腺,从家蚕个体 的后部丝腺抽提DNA,再采用RNase酶消解RNA,所述解剖家蚕取出后部丝 腺的具体步骤为:在无菌条件下解剖家蚕,取后部丝腺,经磷酸盐缓冲液冲洗, 将后部丝腺研磨至粉末;其中,从后部丝腺抽提DNA和采用RNase酶消解 RNA的具体步骤为:

(1)采用DNA酶解缓冲液融化后部丝腺粉末,混匀后将溶液于48~55℃水 浴裂解6~8小时;

(2)加入与步骤(1)中溶液等体积的饱和酚,混匀后离心,取上清液;取与上 清液等体积的正丁醇与上清液混匀,离心后弃上清液,重复离心弃上清液的过 程至少1次,浓缩至0.1ml以下;采用无水乙醇和醋酸钠析出DNA,然后用 TE缓冲液溶解DNA,混匀后至少放置0.5小时;

(3)于35~39℃水浴中,采用RNase酶处理步骤(2)中的DNA溶液,消解去 除RNA;加入与DNA溶液等体积的饱和酚,混匀后离心,除去下层的酚层, 再加入同样体积的饱和酚,混匀后离心,取上清液;

(4)取与步骤(3)中的饱和酚等体积的酚氯仿,与步骤(3)所得的上清液混匀后 离心,再取上清液,并取与之等体积的正丁醇混合均匀,离心后弃上清,重复 离心弃上清的过程至少1次,浓缩至0.1ml以下;采用无水乙醇和醋酸钠析出 DNA,用70~75%的乙醇洗涤,溶解于TE缓冲液中。

上述技术方案中,所述磷酸盐缓冲液(PBS缓冲液)的成分和浓度为:

氯化钠NaCl            137mmol/L,

氯化钾KCl             2.7mmol/L,

磷酸氢二钠Na2HPO4     4.3mmol/L,

磷酸二氢钾KH2PO4      1.4mmol/L;

所述DNA酶解缓冲液的组分和浓度为:

蛋白酶K               0.2mg/ml,

十二烷基硫酸钠SDS     0.5%(重量比),

四乙酸二氨基乙烯EDTA              0.05M;

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